More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_2076 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 382 aa  784    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  65.8 
 
 		 394 aa  523  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  60 
 
 		 390 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  59.49 
 
 		 396 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  57.95 
 
 		 391 aa  472  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  56.89 
 
 		 393 aa  446  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  53.67 
 
 		 399 aa  429  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  60.68 
 
 		 355 aa  424  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  51.91 
 
 		 395 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  53.32 
 
 		 393 aa  415  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  51.15 
 
 		 394 aa  411  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  51.15 
 
 		 397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  52.42 
 
 		 394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  50.25 
 
 		 397 aa  402  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  50.13 
 
 		 394 aa  395  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  49.62 
 
 		 393 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  48.24 
 
 		 399 aa  385  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  50.13 
 
 		 393 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  48.36 
 
 		 422 aa  375  1e-103  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  44.76 
 
 		 390 aa  354  1e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  46.04 
 
 		 405 aa  348  1e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  44.78 
 
 		 407 aa  335  5.999999999999999e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  44.87 
 
 		 409 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  43.91 
 
 		 379 aa  324  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  42.66 
 
 		 399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  43.5 
 
 		 402 aa  311  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  42.79 
 
 		 415 aa  310  4e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  45.53 
 
 		 407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  42.37 
 
 		 404 aa  305  8.000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  41.88 
 
 		 387 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  38.21 
 
 		 410 aa  295  8e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  42.13 
 
 		 387 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  43.22 
 
 		 387 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  42.9 
 
 		 404 aa  289  6e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  41.34 
 
 		 418 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  41.36 
 
 		 406 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  41.36 
 
 		 406 aa  286  5e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  41.82 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  41.16 
 
 		 366 aa  263  4e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  43.38 
 
 		 398 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  40.35 
 
 		 342 aa  256  6e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  36.75 
 
 		 375 aa  253  6e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  39.43 
 
 		 380 aa  251  1e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  36.9 
 
 		 399 aa  249  4e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  40.47 
 
 		 380 aa  249  6e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  39.43 
 
 		 377 aa  243  5e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  41.13 
 
 		 378 aa  243  6e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  37.25 
 
 		 401 aa  243  6e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  38.29 
 
 		 391 aa  242  7.999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  38.9 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  38.38 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  35.8 
 
 		 373 aa  234  3e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  36.13 
 
 		 496 aa  218  1e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  35.08 
 
 		 479 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  37.74 
 
 		 480 aa  199  7e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  36.81 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  35.9 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  35.36 
 
 		 330 aa  193  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  32.19 
 
 		 358 aa  193  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  30.5 
 
 		 358 aa  192  1e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  32.56 
 
 		 354 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  31.91 
 
 		 358 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  34.78 
 
 		 330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  32.28 
 
 		 356 aa  190  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  32.28 
 
 		 356 aa  190  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  33.7 
 
 		 501 aa  186  4e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  32.86 
 
 		 358 aa  186  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  31.52 
 
 		 357 aa  186  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  34.14 
 
 		 414 aa  184  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  34.38 
 
 		 363 aa  182  6e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  33.91 
 
 		 327 aa  182  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  32.56 
 
 		 358 aa  182  8.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  31.81 
 
 		 561 aa  182  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  33.33 
 
 		 349 aa  180  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  32.68 
 
 		 375 aa  180  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  33.05 
 
 		 377 aa  180  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  33.8 
 
 		 359 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  33.15 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  34.77 
 
 		 332 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  32 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  34.64 
 
 		 769 aa  173  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  32.88 
 
 		 369 aa  172  9e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  31.3 
 
 		 370 aa  172  1e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  32.81 
 
 		 382 aa  172  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.95 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  34.2 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  36.93 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  35.62 
 
 		 349 aa  169  9e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  32.24 
 
 		 378 aa  169  1e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  33.53 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  33.9 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  33.52 
 
 		 405 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  31.3 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  32.67 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  32.18 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  40 
 
 		 413 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  32.09 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  35.13 
 
 		 353 aa  159  7e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  32.85 
 
 		 364 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  34.16 
 
 		 389 aa  157  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>