More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1233 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  100 
 
 		 346 aa  719    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  67.54 
 
 		 349 aa  513  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  56.18 
 
 		 358 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  57.77 
 
 		 377 aa  438  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  57.48 
 
 		 359 aa  418  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  57.77 
 
 		 397 aa  421  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  57.48 
 
 		 405 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  57.06 
 
 		 414 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  56.6 
 
 		 399 aa  414  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  55.13 
 
 		 363 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  50.73 
 
 		 561 aa  387  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  55.07 
 
 		 769 aa  383  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  46.8 
 
 		 366 aa  361  1e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  46.94 
 
 		 356 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  47.52 
 
 		 354 aa  352  5e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  46.36 
 
 		 358 aa  351  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  46.06 
 
 		 356 aa  350  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  46.06 
 
 		 358 aa  349  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  46.36 
 
 		 357 aa  348  8e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  46.06 
 
 		 358 aa  344  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  47.48 
 
 		 325 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  43.82 
 
 		 333 aa  309  5e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  45.7 
 
 		 327 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  43.82 
 
 		 330 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  44.41 
 
 		 330 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  41.18 
 
 		 372 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  43.53 
 
 		 335 aa  294  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  42.65 
 
 		 349 aa  293  3e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  43.11 
 
 		 332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  40.06 
 
 		 377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  39.78 
 
 		 378 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  40.65 
 
 		 334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  39.78 
 
 		 377 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  38.33 
 
 		 381 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  39.78 
 
 		 377 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  41.6 
 
 		 380 aa  280  3e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  42.01 
 
 		 330 aa  278  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  39.83 
 
 		 375 aa  276  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  39.83 
 
 		 356 aa  271  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  41.42 
 
 		 333 aa  269  5e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  39.66 
 
 		 372 aa  268  7e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  41.11 
 
 		 364 aa  266  4e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  39.67 
 
 		 496 aa  265  7e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  54.02 
 
 		 413 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  38.44 
 
 		 381 aa  263  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  40.87 
 
 		 353 aa  259  6e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  40.49 
 
 		 389 aa  258  9e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  37.78 
 
 		 479 aa  258  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  37.97 
 
 		 347 aa  252  5.000000000000001e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  35.25 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  38.78 
 
 		 367 aa  249  5e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  37.57 
 
 		 376 aa  248  7e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  36.71 
 
 		 394 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  38.15 
 
 		 444 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  36.22 
 
 		 382 aa  239  4e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  37.54 
 
 		 342 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  36.64 
 
 		 369 aa  237  2e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  33.8 
 
 		 368 aa  237  2e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  35.38 
 
 		 378 aa  236  4e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2740  radical SAM domain-containing protein  38.04 
 
 		 392 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  35.17 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  35.47 
 
 		 364 aa  233  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  38.11 
 
 		 390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  35.38 
 
 		 389 aa  232  7.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  36.65 
 
 		 501 aa  230  2e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  35.42 
 
 		 399 aa  229  5e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  33.8 
 
 		 399 aa  228  8e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  35.14 
 
 		 418 aa  228  2e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  33.24 
 
 		 370 aa  225  1e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  35.59 
 
 		 398 aa  223  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  33.8 
 
 		 350 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  34.35 
 
 		 391 aa  217  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  32.86 
 
 		 480 aa  207  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  34.96 
 
 		 394 aa  206  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  32.74 
 
 		 342 aa  205  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  32.57 
 
 		 393 aa  200  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  34.1 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.86 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  35.38 
 
 		 378 aa  197  3e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  33.62 
 
 		 397 aa  197  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  34.8 
 
 		 377 aa  197  3e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  32.86 
 
 		 393 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  34.5 
 
 		 389 aa  196  6e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  33.61 
 
 		 399 aa  195  9e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  34.09 
 
 		 384 aa  195  9e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  34.29 
 
 		 394 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  35.9 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  34 
 
 		 394 aa  193  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  34.2 
 
 		 355 aa  192  7e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  33.52 
 
 		 380 aa  192  1e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  32.29 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  33.62 
 
 		 391 aa  189  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  31.62 
 
 		 399 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  33.62 
 
 		 405 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  33.52 
 
 		 397 aa  188  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  31.56 
 
 		 375 aa  186  5e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  32.86 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  31.9 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  31.55 
 
 		 393 aa  182  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>