More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0031 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  100 
 
 
372 aa  753    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  65.95 
 
 
380 aa  492  9.999999999999999e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  71.03 
 
 
364 aa  490  1e-137  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  69.44 
 
 
367 aa  488  1e-137  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  46.98 
 
 
377 aa  360  3e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  46.98 
 
 
378 aa  359  4e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  46.98 
 
 
377 aa  359  5e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  46.7 
 
 
377 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  48.08 
 
 
372 aa  350  3e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  50 
 
 
375 aa  345  6e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  47.03 
 
 
386 aa  345  7e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  51.3 
 
 
394 aa  344  2e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  48.11 
 
 
381 aa  330  3e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  45.81 
 
 
364 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  46.11 
 
 
367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  45.65 
 
 
399 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  45.05 
 
 
342 aa  311  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  45.95 
 
 
376 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  46.58 
 
 
389 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  44.41 
 
 
353 aa  302  5.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  42.33 
 
 
349 aa  299  5e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  43.8 
 
 
444 aa  293  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2740  radical SAM domain-containing protein  46.36 
 
 
392 aa  291  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  41.34 
 
 
369 aa  282  5.000000000000001e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  40.17 
 
 
405 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  40.11 
 
 
382 aa  279  5e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  42.08 
 
 
389 aa  278  9e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  40.38 
 
 
378 aa  277  2e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.8 
 
 
397 aa  276  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  40.17 
 
 
414 aa  276  6e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  42.61 
 
 
377 aa  275  8e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  40.9 
 
 
370 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  41.23 
 
 
368 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  39.48 
 
 
359 aa  272  6e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  39.88 
 
 
399 aa  272  9e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  38.68 
 
 
350 aa  269  7e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  39.66 
 
 
346 aa  268  8e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  38.4 
 
 
363 aa  261  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  39.31 
 
 
358 aa  256  6e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  38.42 
 
 
561 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  41.83 
 
 
347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  40.95 
 
 
375 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  36.78 
 
 
358 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  38.16 
 
 
366 aa  236  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  36.49 
 
 
358 aa  236  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  39.49 
 
 
349 aa  233  6e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  37.54 
 
 
354 aa  233  6e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  36.78 
 
 
356 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  36.68 
 
 
356 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  36.49 
 
 
357 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  37.04 
 
 
769 aa  229  8e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  36.68 
 
 
358 aa  228  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  35.67 
 
 
325 aa  215  8e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  35.68 
 
 
356 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  34.88 
 
 
330 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  36.92 
 
 
334 aa  209  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  34.58 
 
 
327 aa  208  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  34.59 
 
 
330 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  37.5 
 
 
335 aa  205  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  33.52 
 
 
381 aa  204  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  32.76 
 
 
479 aa  203  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  34.88 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  31.4 
 
 
496 aa  196  8.000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  33.91 
 
 
332 aa  192  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  32.56 
 
 
333 aa  189  7e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  34.38 
 
 
333 aa  180  4e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  33.42 
 
 
405 aa  166  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  32.07 
 
 
418 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  36 
 
 
413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  33.16 
 
 
407 aa  162  9e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  33.24 
 
 
373 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  34.27 
 
 
398 aa  161  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  30.97 
 
 
501 aa  159  8e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  29.83 
 
 
390 aa  156  6e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  31.3 
 
 
399 aa  155  8e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  34.69 
 
 
409 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  27.89 
 
 
410 aa  153  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.86 
 
 
394 aa  152  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  28.61 
 
 
480 aa  151  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  32.69 
 
 
377 aa  150  4e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  32.87 
 
 
491 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  32.87 
 
 
491 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  32.87 
 
 
491 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  32.87 
 
 
491 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  32.87 
 
 
491 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  32.87 
 
 
491 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  30.39 
 
 
384 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  32.58 
 
 
491 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  32.3 
 
 
491 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  32.31 
 
 
407 aa  146  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  32.4 
 
 
487 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 
389 aa  146  6e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  32.87 
 
 
491 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  30.75 
 
 
393 aa  145  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  28.69 
 
 
397 aa  145  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  28.85 
 
 
394 aa  145  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  31.02 
 
 
380 aa  144  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  29.25 
 
 
393 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.33 
 
 
399 aa  143  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  31.74 
 
 
404 aa  143  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.992211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>