More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2081 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 409 aa  830    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  74.87 
 
 		 407 aa  595  1e-169  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  71.36 
 
 		 405 aa  593  1e-168  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  49.24 
 
 		 393 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  45.78 
 
 		 390 aa  372  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  48.1 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  49.11 
 
 		 395 aa  362  6e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  47.44 
 
 		 394 aa  362  8e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  48.21 
 
 		 401 aa  358  7e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  45.38 
 
 		 391 aa  352  5e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  46.67 
 
 		 396 aa  350  3e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  45.64 
 
 		 390 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  44.5 
 
 		 394 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  45.04 
 
 		 394 aa  343  4e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  43.48 
 
 		 394 aa  342  5e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  44.86 
 
 		 397 aa  342  9e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  44.87 
 
 		 382 aa  338  9.999999999999999e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  44.76 
 
 		 393 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  44.97 
 
 		 422 aa  332  8e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  44.22 
 
 		 397 aa  331  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  44.39 
 
 		 393 aa  330  3e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  45.01 
 
 		 393 aa  329  4e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  43.22 
 
 		 399 aa  318  2e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  44.73 
 
 		 355 aa  301  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.73 
 
 		 399 aa  286  5.999999999999999e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  39.77 
 
 		 379 aa  282  7.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  40.06 
 
 		 402 aa  276  7e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  41.11 
 
 		 407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  39.77 
 
 		 406 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  39.77 
 
 		 406 aa  268  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  36.56 
 
 		 404 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  37.16 
 
 		 415 aa  267  2.9999999999999995e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  35.79 
 
 		 410 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  38.32 
 
 		 404 aa  263  4e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  37.15 
 
 		 399 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  39.44 
 
 		 418 aa  262  6.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  39.5 
 
 		 387 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  41.9 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  40.91 
 
 		 387 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  38.5 
 
 		 398 aa  256  5e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  37.5 
 
 		 387 aa  249  8e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  38.14 
 
 		 389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  37.22 
 
 		 387 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  37.47 
 
 		 377 aa  238  2e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  37.89 
 
 		 380 aa  237  2e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  39.14 
 
 		 366 aa  237  3e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  39.02 
 
 		 342 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  38.35 
 
 		 384 aa  229  5e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  36.18 
 
 		 380 aa  227  3e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  36.08 
 
 		 378 aa  223  3e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  32.96 
 
 		 375 aa  218  1e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  35.68 
 
 		 479 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  34.43 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  37.46 
 
 		 330 aa  209  6e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  36.31 
 
 		 330 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  37.57 
 
 		 334 aa  193  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  36.59 
 
 		 480 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  37.4 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  34.16 
 
 		 496 aa  188  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  32.95 
 
 		 346 aa  184  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  33.24 
 
 		 501 aa  183  6e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  36.24 
 
 		 349 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  37.17 
 
 		 380 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  34.1 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  36.1 
 
 		 333 aa  177  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  32 
 
 		 359 aa  176  8e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  33.43 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  30.66 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  33.79 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  33.53 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  33.42 
 
 		 368 aa  169  6e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  30.84 
 
 		 405 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  30.35 
 
 		 399 aa  168  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  32.66 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  30.85 
 
 		 561 aa  167  4e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  34.69 
 
 		 372 aa  167  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  32.38 
 
 		 349 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  31.61 
 
 		 375 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  35.82 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.52 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  33.15 
 
 		 370 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  31.23 
 
 		 377 aa  163  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  33.51 
 
 		 382 aa  162  8.000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  29.8 
 
 		 356 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  29.92 
 
 		 363 aa  160  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  27.09 
 
 		 358 aa  159  6e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  33.14 
 
 		 373 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  34.79 
 
 		 367 aa  159  8e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  29.51 
 
 		 354 aa  159  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  29.51 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  34.17 
 
 		 378 aa  158  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  30.55 
 
 		 358 aa  157  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  32.16 
 
 		 769 aa  156  6e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  28.24 
 
 		 358 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  28.24 
 
 		 358 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  31.52 
 
 		 366 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  29.78 
 
 		 358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  32.8 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  30.24 
 
 		 386 aa  152  8.999999999999999e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>