More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1987 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  100 
 
 		 373 aa  769    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  57.91 
 
 		 375 aa  437  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.85 
 
 		 399 aa  298  1e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  40.48 
 
 		 387 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  40.74 
 
 		 387 aa  289  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  40.05 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  39.52 
 
 		 387 aa  285  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  39.68 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  38.85 
 
 		 387 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  37.66 
 
 		 410 aa  281  9e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  38.99 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  38.52 
 
 		 358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  37.93 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  38.22 
 
 		 406 aa  269  7e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  38.22 
 
 		 406 aa  268  8e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  40.96 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  37.44 
 
 		 418 aa  258  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  39.15 
 
 		 390 aa  255  8e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  37.68 
 
 		 394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  39.09 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  36.75 
 
 		 407 aa  252  6e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  37.03 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  36.39 
 
 		 397 aa  247  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  37.1 
 
 		 393 aa  246  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  38.75 
 
 		 366 aa  243  3e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  36.22 
 
 		 394 aa  243  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  34.76 
 
 		 397 aa  241  1e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  37.22 
 
 		 391 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  36.76 
 
 		 394 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  35.75 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  35.19 
 
 		 422 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  36.29 
 
 		 399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  35.41 
 
 		 395 aa  233  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  35.8 
 
 		 382 aa  234  3e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  35.31 
 
 		 393 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  34.66 
 
 		 399 aa  229  8e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  36.47 
 
 		 355 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  36.59 
 
 		 393 aa  228  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  34.66 
 
 		 407 aa  223  3e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  35.03 
 
 		 405 aa  222  7e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  31.96 
 
 		 415 aa  206  7e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  34.43 
 
 		 409 aa  204  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  33.51 
 
 		 479 aa  200  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  32.7 
 
 		 496 aa  200  3e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  35.13 
 
 		 399 aa  197  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  33.94 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  33.85 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  35.84 
 
 		 380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  35.04 
 
 		 377 aa  182  7e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  35.26 
 
 		 378 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  30.65 
 
 		 501 aa  179  4.999999999999999e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  29.72 
 
 		 401 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  34.47 
 
 		 380 aa  179  7e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  34.1 
 
 		 389 aa  179  8e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  32.55 
 
 		 342 aa  178  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  36.23 
 
 		 325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  33.43 
 
 		 384 aa  172  9e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  32.41 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  33.43 
 
 		 349 aa  159  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  32.31 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  30.68 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  30.03 
 
 		 363 aa  153  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  29.81 
 
 		 377 aa  152  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  28.73 
 
 		 350 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  32.36 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  26.82 
 
 		 561 aa  147  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  30.03 
 
 		 356 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  30.03 
 
 		 358 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  29.89 
 
 		 358 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  30.64 
 
 		 358 aa  146  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 		 480 aa  146  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 330 aa  146  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 		 405 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  30.32 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  29.74 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  28.36 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  28.73 
 
 		 399 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.42 
 
 		 397 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  29.74 
 
 		 357 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  28.42 
 
 		 394 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  28.23 
 
 		 414 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  29.62 
 
 		 389 aa  143  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  30.34 
 
 		 349 aa  142  7e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  30.95 
 
 		 366 aa  142  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  29.71 
 
 		 333 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  27.49 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  27.83 
 
 		 373 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  29.05 
 
 		 369 aa  139  7.999999999999999e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  30.12 
 
 		 334 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  29.75 
 
 		 372 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  28.98 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  28.22 
 
 		 389 aa  137  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  28.95 
 
 		 330 aa  137  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 		 378 aa  135  8e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  29.97 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  31.43 
 
 		 359 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  29.79 
 
 		 335 aa  132  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  28.96 
 
 		 382 aa  132  9e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  27.35 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  28.45 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>