More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0734 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 401 aa  802    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  53.57 
 
 		 407 aa  401  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  47.96 
 
 		 405 aa  375  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  49.1 
 
 		 409 aa  354  1e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  38.52 
 
 		 390 aa  280  5e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  42.25 
 
 		 393 aa  277  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  37.91 
 
 		 397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  41.18 
 
 		 395 aa  272  6e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  37.84 
 
 		 396 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.39 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  40.34 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  39.28 
 
 		 399 aa  266  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  41.32 
 
 		 422 aa  266  4e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  40.34 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  37.56 
 
 		 390 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  39.01 
 
 		 399 aa  262  8.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  38.32 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  36.8 
 
 		 391 aa  260  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  39.15 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  41.08 
 
 		 394 aa  258  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  35.97 
 
 		 404 aa  253  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  37.67 
 
 		 399 aa  253  6e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  36.78 
 
 		 379 aa  252  7e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  37.43 
 
 		 393 aa  245  9e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  38.08 
 
 		 406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  37.08 
 
 		 402 aa  243  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  38.08 
 
 		 406 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  37.25 
 
 		 382 aa  243  6e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  38.24 
 
 		 355 aa  242  7e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 		 418 aa  242  7.999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  39.33 
 
 		 387 aa  240  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  36.67 
 
 		 404 aa  239  8e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  37.64 
 
 		 407 aa  239  9e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  39.72 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  38.84 
 
 		 387 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  32.32 
 
 		 410 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  33.16 
 
 		 387 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  35.08 
 
 		 387 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  37.08 
 
 		 399 aa  210  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  32.93 
 
 		 415 aa  203  6e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  34.82 
 
 		 366 aa  196  5.000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  30.97 
 
 		 375 aa  196  8.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  37.16 
 
 		 398 aa  195  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  36.41 
 
 		 391 aa  192  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  33.92 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  33.83 
 
 		 380 aa  182  1e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  34.29 
 
 		 389 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  29.72 
 
 		 373 aa  179  8e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  33.83 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  33.23 
 
 		 342 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  33.68 
 
 		 384 aa  169  6e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 		 378 aa  169  9e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  33.61 
 
 		 349 aa  150  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  31.73 
 
 		 479 aa  149  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  31.59 
 
 		 325 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  25.42 
 
 		 358 aa  147  4.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  30.05 
 
 		 501 aa  143  6e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  31.79 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  29.05 
 
 		 561 aa  140  4.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  31.27 
 
 		 373 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  28.93 
 
 		 496 aa  136  7.000000000000001e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  31.92 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  29.06 
 
 		 399 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  29.77 
 
 		 327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  29.91 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  28.08 
 
 		 414 aa  131  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  28.3 
 
 		 359 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  28.85 
 
 		 363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  28.94 
 
 		 330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  28.65 
 
 		 769 aa  127  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  28.16 
 
 		 346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  28.03 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  30.94 
 
 		 380 aa  123  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  28.94 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.73 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  28.37 
 
 		 332 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  28.77 
 
 		 480 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  30.23 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  27 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  28.03 
 
 		 347 aa  116  6e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  28.92 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 358 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  28.81 
 
 		 368 aa  113  5e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  27.12 
 
 		 356 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  30.03 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  32.5 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  28.69 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  28.65 
 
 		 359 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  26.27 
 
 		 357 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  27.67 
 
 		 333 aa  109  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  28.3 
 
 		 366 aa  109  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  27.64 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  28.76 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  28.61 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  26.55 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  27.98 
 
 		 370 aa  107  5e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  29.11 
 
 		 333 aa  106  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  24.14 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>