More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_06670 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  96.64 
 
 
387 aa  741    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  100 
 
 
387 aa  785    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  54.47 
 
 
404 aa  458  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  55.04 
 
 
410 aa  456  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  56.69 
 
 
402 aa  439  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  54.57 
 
 
387 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  52.51 
 
 
379 aa  426  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  54.59 
 
 
399 aa  425  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  55.09 
 
 
406 aa  425  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  55.61 
 
 
387 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  54.84 
 
 
418 aa  423  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  55.09 
 
 
406 aa  424  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  51.18 
 
 
404 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  47.66 
 
 
407 aa  339  4e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  42.06 
 
 
399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  41.88 
 
 
382 aa  300  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  42.38 
 
 
396 aa  300  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  43.5 
 
 
394 aa  297  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  41.81 
 
 
393 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  40.48 
 
 
373 aa  293  4e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  41.8 
 
 
390 aa  293  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  41.41 
 
 
391 aa  291  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  41.29 
 
 
395 aa  289  7e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  39.83 
 
 
397 aa  288  9e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  42.62 
 
 
422 aa  285  7e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  39.05 
 
 
375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  41.27 
 
 
399 aa  283  5.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  38.66 
 
 
394 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  42.17 
 
 
355 aa  281  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  40.96 
 
 
393 aa  281  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  40.26 
 
 
393 aa  280  3e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  38.94 
 
 
394 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  38.31 
 
 
390 aa  277  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  38.61 
 
 
397 aa  271  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  37.64 
 
 
394 aa  269  7e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  39.83 
 
 
393 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  40.05 
 
 
415 aa  262  8e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  38.06 
 
 
405 aa  249  5e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  36.8 
 
 
407 aa  248  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  40.9 
 
 
399 aa  247  3e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  35.2 
 
 
358 aa  246  4e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  40.47 
 
 
391 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  37.5 
 
 
409 aa  237  3e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  39.12 
 
 
398 aa  227  3e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  34.53 
 
 
401 aa  219  7e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  33.59 
 
 
366 aa  205  1e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  35.19 
 
 
342 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  32.23 
 
 
378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  33.14 
 
 
384 aa  178  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  33.52 
 
 
389 aa  177  4e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  34.16 
 
 
380 aa  176  5e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
380 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  33.9 
 
 
479 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  34.1 
 
 
377 aa  171  2e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  30.63 
 
 
496 aa  170  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  30.27 
 
 
377 aa  158  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2082  radical SAM family protein  34.15 
 
 
321 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.460163 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  30.17 
 
 
361 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  31.73 
 
 
480 aa  153  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  30.88 
 
 
349 aa  153  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  29.43 
 
 
327 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  28.17 
 
 
561 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  33.43 
 
 
349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  32.23 
 
 
366 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 
358 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  31.89 
 
 
375 aa  147  3e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  29.75 
 
 
501 aa  145  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  26.7 
 
 
346 aa  143  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  27.37 
 
 
363 aa  140  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  33.05 
 
 
335 aa  140  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  27.56 
 
 
414 aa  140  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  28.7 
 
 
330 aa  139  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  29.97 
 
 
375 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  30.88 
 
 
325 aa  139  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  27.53 
 
 
358 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  29.8 
 
 
330 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  27.53 
 
 
358 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  30.81 
 
 
334 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  27.69 
 
 
399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.76 
 
 
397 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  31.65 
 
 
372 aa  134  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  28.08 
 
 
333 aa  134  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  28.74 
 
 
333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 
357 aa  133  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  29.28 
 
 
373 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  27.89 
 
 
381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 
380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  27.83 
 
 
330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  26.78 
 
 
354 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  29.8 
 
 
394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  31.83 
 
 
359 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  27.3 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  27.3 
 
 
378 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  28.7 
 
 
368 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  27.3 
 
 
377 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  28.93 
 
 
358 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  27.58 
 
 
377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 
359 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  28.13 
 
 
382 aa  126  7e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  30.03 
 
 
378 aa  125  9e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>