More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0511 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
366 aa  752    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  41.75 
 
 
396 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  40.57 
 
 
391 aa  279  5e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  40.67 
 
 
390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  39.65 
 
 
397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  41.16 
 
 
382 aa  263  4e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 
394 aa  263  4.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.23 
 
 
394 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  40.26 
 
 
393 aa  260  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  43.14 
 
 
355 aa  257  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  37.95 
 
 
394 aa  257  3e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  38.46 
 
 
393 aa  256  5e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  38.32 
 
 
422 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  37.72 
 
 
399 aa  253  3e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  38.54 
 
 
397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  40 
 
 
405 aa  251  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  39.9 
 
 
395 aa  250  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  39.69 
 
 
399 aa  249  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  38.07 
 
 
394 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  39.13 
 
 
407 aa  247  3e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  38.75 
 
 
373 aa  243  3e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  38.07 
 
 
393 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  38.05 
 
 
393 aa  239  5.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  35.73 
 
 
390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  39.14 
 
 
409 aa  225  1e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  34.63 
 
 
415 aa  222  9.999999999999999e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  39.83 
 
 
377 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  40.99 
 
 
380 aa  217  2e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  38.68 
 
 
389 aa  218  2e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  35.24 
 
 
375 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  37.11 
 
 
407 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  32.88 
 
 
358 aa  212  9e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  38.44 
 
 
384 aa  209  5e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  33.59 
 
 
387 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  36 
 
 
379 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  39.3 
 
 
380 aa  204  2e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  35.98 
 
 
399 aa  204  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  36.01 
 
 
342 aa  204  3e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  33.51 
 
 
399 aa  202  6e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  35.6 
 
 
378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  33.51 
 
 
410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  32.82 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  36.29 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  35.14 
 
 
387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  33.14 
 
 
404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  35.31 
 
 
404 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  34.82 
 
 
401 aa  196  5.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  34.04 
 
 
402 aa  195  9e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  31.97 
 
 
406 aa  192  7e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  31.71 
 
 
406 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  33.85 
 
 
398 aa  191  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  32.87 
 
 
391 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  32.96 
 
 
501 aa  183  5.0000000000000004e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  32.58 
 
 
418 aa  175  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  32.95 
 
 
479 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  35.14 
 
 
480 aa  169  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  31.32 
 
 
496 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  31.83 
 
 
333 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 
389 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  31.16 
 
 
330 aa  146  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  28.83 
 
 
332 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  29.67 
 
 
349 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 
349 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  30.79 
 
 
325 aa  140  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  29.6 
 
 
373 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  29 
 
 
330 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  29.83 
 
 
375 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  30 
 
 
346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  30 
 
 
359 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  29.82 
 
 
358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  28.79 
 
 
335 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  39.68 
 
 
413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  27.22 
 
 
330 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 
327 aa  126  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 
368 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  29.68 
 
 
372 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 
418 aa  123  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  28.19 
 
 
394 aa  123  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  28.95 
 
 
377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  30.5 
 
 
347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  26.67 
 
 
561 aa  120  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  27.49 
 
 
363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  31.86 
 
 
367 aa  119  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  27.11 
 
 
333 aa  119  9e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.22 
 
 
397 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  27.11 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  27.22 
 
 
380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  27.72 
 
 
372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  25.14 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 
427 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 
376 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 
334 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  27.93 
 
 
370 aa  116  6e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  29.23 
 
 
347 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  28.45 
 
 
356 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  26.07 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  28.45 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  26.76 
 
 
364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 
399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>