111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12320 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_12320  transcriptional regulator  100 
 
 
385 aa  803    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.601  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2066  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.58 
 
 
359 aa  281  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.348008  hitchhiker  0.0096425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3349  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.64 
 
 
337 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  38.64 
 
 
769 aa  213  2.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0512  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
341 aa  190  4e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3269  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
322 aa  179  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.764297  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0505  AsnC family transcriptional regulator  29.69 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2612  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
349 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5014  AsnC family transcriptional regulator  31.18 
 
 
327 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4037  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
328 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2287  AsnC family transcriptional regulator  27.85 
 
 
351 aa  167  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4224  putative heme biosynthesis protein  30.39 
 
 
372 aa  164  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4937  putative AsnC family transcriptional regulator  31.56 
 
 
330 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.456473 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0344  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.65 
 
 
337 aa  160  3e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00313859  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5931  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.75 
 
 
361 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.7792  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0453  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.89 
 
 
338 aa  156  6e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000254867  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0074  AsnC family transcriptional regulator  30.69 
 
 
334 aa  156  7e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1976  AsnC family transcriptional regulator  28.91 
 
 
332 aa  155  8e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.481877  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1909  AsnC family transcriptional regulator  29.32 
 
 
348 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0086  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.49 
 
 
371 aa  150  4e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1714  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.06 
 
 
348 aa  149  9e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0511  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.95 
 
 
346 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1585  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.65 
 
 
345 aa  146  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208973  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1256  putative transcriptional regulator, AsnC family  46.05 
 
 
155 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.387392  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2130  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.8 
 
 
361 aa  142  8e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.826373  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3176  nitrite reductase heme biosynthesis D protein  29.44 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1614  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
359 aa  139  6e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000928597  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2198  AsnC family transcriptional regulator  47.86 
 
 
172 aa  139  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00973271  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1221  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.6 
 
 
363 aa  139  7.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1342  AsnC family transcriptional regulator  48.3 
 
 
157 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1129  putative transcriptional regulator, AsnC family  46.98 
 
 
156 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.875514 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2894  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.26 
 
 
349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0895159  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2900  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.34 
 
 
165 aa  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179211 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0286  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.41 
 
 
173 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1445  AsnC family transcriptional regulator  28.38 
 
 
338 aa  136  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.943985 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0464  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 
150 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000584146  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2158  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
153 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.53463  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1255  putative transcriptional regulator, AsnC family  46.54 
 
 
173 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.3 
 
 
360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1956  putative transcriptional regulator, AsnC family  46.2 
 
 
165 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.231554 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2129  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 
176 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394318  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2578  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 
164 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2422  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.36 
 
 
161 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000360306 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1257  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.24 
 
 
155 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192056  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1231  AsnC family transcriptional regulator  41.36 
 
 
159 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000551227  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2394  putative transcriptional regulator, AsnC family  47.02 
 
 
152 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2197  AsnC family transcriptional regulator  40.83 
 
 
160 aa  124  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00194036  normal  0.364618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1459  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
182 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1460  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
152 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2491  AsnC family transcriptional regulator  29.01 
 
 
323 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.635562 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1232  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
151 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000917912  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1254  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.15 
 
 
161 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1341  AsnC family transcriptional regulator  35.58 
 
 
155 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2996  AsnC family transcriptional regulator  39.05 
 
 
159 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2157  AsnC family transcriptional regulator  38.18 
 
 
157 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.91704  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0692  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 
156 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2503  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 
166 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3267  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 
158 aa  109  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381934  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1134  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
149 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0641869  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1130  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.93 
 
 
176 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.853414 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3002  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.98 
 
 
156 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0047  AsnC family transcriptional regulator  36.53 
 
 
162 aa  107  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0361845  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2018  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
159 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1708  AsnC family transcriptional regulator  27.99 
 
 
323 aa  101  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00654875 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0072  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 
166 aa  100  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.598742  normal  0.790433 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2627  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.35 
 
 
170 aa  100  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0212574 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3179  AsnC family transcriptional regulator  32.54 
 
 
158 aa  100  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0219  AsnC family transcriptional regulator  34.76 
 
 
160 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.735917  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0878  AsnC family transcriptional regulator  33.95 
 
 
164 aa  98.2  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0177181  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2246  AsnC family transcriptional regulator  26.7 
 
 
323 aa  97.4  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  0.373627 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0693  AsnC family transcriptional regulator  33.75 
 
 
156 aa  95.5  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06710  putative transcriptional regulator  38.16 
 
 
150 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179888  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1712  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.57 
 
 
160 aa  94.4  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0044  AsnC family transcriptional regulator  26.33 
 
 
332 aa  94  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.268461  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1907  AsnC family transcriptional regulator  34.57 
 
 
160 aa  93.6  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0957  AsnC family transcriptional regulator  40.25 
 
 
165 aa  93.6  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0616  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 
150 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3129  AsnC family transcriptional regulator  33.93 
 
 
173 aa  92.8  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4225  putative heme biosynthesis protein  34.25 
 
 
170 aa  92  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0615  heme d1 biosynthesis protein NirL  33.99 
 
 
174 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06700  heme d1 biosynthesis protein NirL  32.68 
 
 
174 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0791164  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5016  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 
166 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380949  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4226  putative heme biosythesis protein  32.95 
 
 
183 aa  90.1  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0877  AsnC family transcriptional regulator  34.18 
 
 
164 aa  89.7  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173236  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3127  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
178 aa  89.7  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3174  putative nitrite reductase heme biosynthesis H protein  32.52 
 
 
161 aa  87.4  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2610  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.37 
 
 
189 aa  87.4  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0956  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 
162 aa  86.7  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1222  putative transcriptional regulator, AsnC family  22.73 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3268  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
152 aa  83.6  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.573654  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06680  hypothetical protein  34.84 
 
 
171 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00214108  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0613  hypothetical protein  34.19 
 
 
171 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0962  AsnC family transcriptional regulator  24.66 
 
 
322 aa  80.5  0.00000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.571479  hitchhiker  0.00125709 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2493  AsnC family transcriptional regulator  31.45 
 
 
160 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2628  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.87 
 
 
162 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.977143  normal  0.0209854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0614  putative transcriptional regulator  29.45 
 
 
147 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3175  nitrite reductase heme biosynthesis G  32.39 
 
 
149 aa  77.4  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06690  putative transcriptional regulator  28.77 
 
 
147 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0225881  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3126  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 
154 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3128  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
166 aa  75.1  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>