111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5014 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5014  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
327 aa  662    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4937  putative AsnC family transcriptional regulator  58.59 
 
 
330 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.456473 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0074  AsnC family transcriptional regulator  42.09 
 
 
334 aa  239  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2612  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.31 
 
 
349 aa  233  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3269  AsnC family transcriptional regulator  42.32 
 
 
322 aa  231  9e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.764297  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4224  putative heme biosynthesis protein  36.89 
 
 
372 aa  230  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1909  AsnC family transcriptional regulator  41.46 
 
 
348 aa  219  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1714  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.85 
 
 
348 aa  216  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2491  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
323 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.635562 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3176  nitrite reductase heme biosynthesis D protein  34.88 
 
 
331 aa  197  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1445  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
338 aa  193  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.943985 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1585  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.47 
 
 
345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208973  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2894  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.13 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0895159  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0511  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.35 
 
 
346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2066  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 
359 aa  172  6.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.348008  hitchhiker  0.0096425 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0086  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.99 
 
 
371 aa  169  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12320  transcriptional regulator  31.18 
 
 
385 aa  167  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.601  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4037  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0344  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.1 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00313859  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2130  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.4 
 
 
361 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.826373  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3349  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.25 
 
 
337 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1221  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.63 
 
 
363 aa  146  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2287  AsnC family transcriptional regulator  30.37 
 
 
351 aa  143  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.81 
 
 
360 aa  143  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1614  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.94 
 
 
359 aa  143  4e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000928597  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1976  AsnC family transcriptional regulator  27.38 
 
 
332 aa  140  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.481877  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0512  AsnC family transcriptional regulator  26.56 
 
 
341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0453  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.76 
 
 
338 aa  136  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000254867  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3127  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
178 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  31.75 
 
 
769 aa  135  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0072  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 
166 aa  132  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.598742  normal  0.790433 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0505  AsnC family transcriptional regulator  29.45 
 
 
353 aa  132  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0615  heme d1 biosynthesis protein NirL  45.34 
 
 
174 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06700  heme d1 biosynthesis protein NirL  43.83 
 
 
174 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0791164  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06710  putative transcriptional regulator  48.25 
 
 
150 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179888  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2610  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.59 
 
 
189 aa  119  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5931  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.67 
 
 
361 aa  119  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.7792  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3267  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
158 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381934  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1907  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 
160 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0616  putative transcriptional regulator  47.55 
 
 
150 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1712  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.87 
 
 
160 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4226  putative heme biosythesis protein  38.52 
 
 
183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5016  AsnC family transcriptional regulator  38.12 
 
 
166 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380949  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1460  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 
152 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2246  AsnC family transcriptional regulator  27.3 
 
 
323 aa  107  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  0.373627 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3129  AsnC family transcriptional regulator  36.54 
 
 
173 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3174  putative nitrite reductase heme biosynthesis H protein  35.4 
 
 
161 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0044  AsnC family transcriptional regulator  29.53 
 
 
332 aa  104  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.268461  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1708  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 
323 aa  104  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00654875 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06680  hypothetical protein  37.66 
 
 
171 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00214108  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2157  AsnC family transcriptional regulator  32.82 
 
 
157 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.91704  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3126  AsnC family transcriptional regulator  40.71 
 
 
154 aa  103  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1257  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.9 
 
 
155 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192056  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1254  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 
161 aa  102  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0613  hypothetical protein  36.36 
 
 
171 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0150  AsnC family transcriptional regulator  25.64 
 
 
321 aa  100  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.587546  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1231  AsnC family transcriptional regulator  33.97 
 
 
159 aa  100  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000551227  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1341  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 
155 aa  99.8  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2493  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
160 aa  99  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1232  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 
151 aa  98.6  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000917912  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1447  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 
160 aa  97.1  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.836924 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0047  AsnC family transcriptional regulator  32.9 
 
 
162 aa  96.3  6e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0361845  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1222  putative transcriptional regulator, AsnC family  21.96 
 
 
327 aa  95.9  9e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2996  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 
159 aa  95.5  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0962  AsnC family transcriptional regulator  29.1 
 
 
322 aa  94.4  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.571479  hitchhiker  0.00125709 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2198  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 
172 aa  94  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00973271  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1130  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.72 
 
 
176 aa  94  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.853414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1459  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
182 aa  89.7  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0464  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 
150 aa  89.4  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000584146  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0878  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
164 aa  88.6  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0177181  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0219  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 
160 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.735917  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2422  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.47 
 
 
161 aa  88.2  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000360306 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2503  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.26 
 
 
166 aa  87  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2158  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
153 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.53463  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4225  putative heme biosynthesis protein  32.86 
 
 
170 aa  85.1  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1255  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 
173 aa  85.5  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0614  putative transcriptional regulator  37.59 
 
 
147 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2394  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.78 
 
 
152 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1342  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 
157 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3128  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 
166 aa  83.6  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1129  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.875514 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3179  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2197  AsnC family transcriptional regulator  37.69 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00194036  normal  0.364618 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1956  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.01 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.231554 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1256  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.14 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.387392  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06690  putative transcriptional regulator  36.17 
 
 
147 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0225881  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0956  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 
162 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1446  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.855842 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2018  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.24 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0693  AsnC family transcriptional regulator  27.1 
 
 
156 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2627  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.72 
 
 
170 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0212574 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0286  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.17 
 
 
173 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0877  AsnC family transcriptional regulator  32.68 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173236  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0692  AsnC family transcriptional regulator  27.86 
 
 
156 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1713  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
160 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259124  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3268  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 
152 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.573654  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1134  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 
149 aa  73.9  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0641869  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1908  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 
160 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0957  AsnC family transcriptional regulator  31.72 
 
 
165 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0013  AsnC family transcriptional regulator  23.47 
 
 
321 aa  72.4  0.000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000293296  normal  0.0126394 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>