105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4226 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4226  putative heme biosythesis protein  100 
 
 		 183 aa  383  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06680  hypothetical protein  53.33 
 
 		 171 aa  185  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00214108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0613  hypothetical protein  52.12 
 
 		 171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3129  AsnC family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 173 aa  181  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3267  AsnC family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 158 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0072  AsnC family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.598742  normal  0.790433 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3174  putative nitrite reductase heme biosynthesis H protein  47.95 
 
 		 161 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2493  AsnC family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 160 aa  168  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1907  AsnC family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 160 aa  164  8e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5016  AsnC family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 166 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380949  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1712  putative transcriptional regulator, AsnC family  46.99 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2610  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.27 
 
 		 189 aa  154  9e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.29 
 
 		 360 aa  151  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1447  AsnC family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 160 aa  145  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.836924 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1221  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.35 
 
 		 363 aa  144  8.000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2130  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.07 
 
 		 361 aa  141  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.826373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1614  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.15 
 
 		 359 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000928597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1585  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.43 
 
 		 345 aa  117  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1976  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 332 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.481877  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2894  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.22 
 
 		 349 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0895159  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3127  AsnC family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1460  AsnC family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 152 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0086  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.71 
 
 		 371 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5014  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 327 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0074  AsnC family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 334 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1130  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.9 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.853414 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0453  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.07 
 
 		 338 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000254867  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2287  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 351 aa  108  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4224  putative heme biosynthesis protein  45 
 
 		 372 aa  107  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3269  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 322 aa  107  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.764297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2157  AsnC family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 157 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.91704  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1257  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.93 
 
 		 155 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4937  putative AsnC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 330 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.456473 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0511  putative transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 		 346 aa  104  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1231  AsnC family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000551227  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2996  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 159 aa  101  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3179  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 158 aa  99  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06700  heme d1 biosynthesis protein NirL  36.76 
 
 		 174 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0791164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0615  heme d1 biosynthesis protein NirL  36.76 
 
 		 174 aa  99  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0344  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.43 
 
 		 337 aa  98.6  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00313859  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2503  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.07 
 
 		 166 aa  99  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4037  AsnC family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 328 aa  97.8  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0512  AsnC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 341 aa  97.1  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3349  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.04 
 
 		 337 aa  95.1  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5931  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.44 
 
 		 361 aa  95.1  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.7792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1341  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 155 aa  94.7  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0219  AsnC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 160 aa  94.4  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.735917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0956  AsnC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 162 aa  94  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0505  AsnC family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 353 aa  93.2  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0693  AsnC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2612  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.71 
 
 		 349 aa  91.7  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1445  AsnC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 338 aa  90.9  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.943985 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2018  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.61 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12320  transcriptional regulator  32.95 
 
 		 385 aa  90.1  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1254  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.78 
 
 		 161 aa  89  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1909  AsnC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 348 aa  87  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1714  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.8 
 
 		 348 aa  87.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0047  AsnC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 162 aa  85.1  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0361845  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3002  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.5 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2422  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.83 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000360306 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2066  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.83 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.348008  hitchhiker  0.0096425 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  35.9 
 
 		 769 aa  79.7  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3176  nitrite reductase heme biosynthesis D protein  28.46 
 
 		 331 aa  77.8  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2197  AsnC family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00194036  normal  0.364618 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2491  AsnC family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.635562 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2628  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.36 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.977143  normal  0.0209854 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0877  AsnC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173236  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0464  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000584146  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2627  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.31 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0212574 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1956  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.96 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.231554 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2246  AsnC family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  0.373627 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1256  putative transcriptional regulator, AsnC family  23.4 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.387392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1255  putative transcriptional regulator, AsnC family  24.62 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2158  AsnC family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.53463  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2394  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1222  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.78 
 
 		 327 aa  57.8  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1129  putative transcriptional regulator, AsnC family  24.44 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.875514 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1708  AsnC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00654875 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1342  AsnC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 157 aa  57  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0286  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.9 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2578  AsnC family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0692  AsnC family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0044  AsnC family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 332 aa  54.3  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.268461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2129  AsnC family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2900  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.68 
 
 		 165 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179211 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3126  AsnC family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 154 aa  52.8  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0962  AsnC family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 322 aa  52.8  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.571479  hitchhiker  0.00125709 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2198  AsnC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 172 aa  51.2  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00973271  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1134  AsnC family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0641869  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0013  AsnC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 321 aa  50.1  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000293296  normal  0.0126394 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0616  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06710  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 150 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0878  AsnC family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 164 aa  48.9  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0177181  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0150  AsnC family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 321 aa  48.5  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.587546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0957  AsnC family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 165 aa  48.1  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1459  AsnC family transcriptional regulator  21.37 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0773  AsnC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 154 aa  44.7  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0723  AsnC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 154 aa  44.7  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4225  putative heme biosynthesis protein  22.13 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>