105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0613 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0613  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  345  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06680  hypothetical protein  96.49 
 
 
171 aa  337  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00214108  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3129  AsnC family transcriptional regulator  54.65 
 
 
173 aa  194  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2493  AsnC family transcriptional regulator  62.67 
 
 
160 aa  186  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0072  AsnC family transcriptional regulator  58.94 
 
 
166 aa  184  8e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.598742  normal  0.790433 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4226  putative heme biosythesis protein  52.12 
 
 
183 aa  182  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3174  putative nitrite reductase heme biosynthesis H protein  57.24 
 
 
161 aa  181  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3267  AsnC family transcriptional regulator  53.9 
 
 
158 aa  176  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381934  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1907  AsnC family transcriptional regulator  55.56 
 
 
160 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5016  AsnC family transcriptional regulator  57.43 
 
 
166 aa  171  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380949  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1712  putative transcriptional regulator, AsnC family  54.9 
 
 
160 aa  170  6.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1447  AsnC family transcriptional regulator  52.63 
 
 
160 aa  149  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.836924 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2610  putative transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
189 aa  145  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1221  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.83 
 
 
363 aa  142  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2130  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.5 
 
 
361 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.826373  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.2 
 
 
360 aa  137  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1614  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.4 
 
 
359 aa  134  9e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000928597  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0074  AsnC family transcriptional regulator  44.72 
 
 
334 aa  133  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3269  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
322 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.764297  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1585  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.79 
 
 
345 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208973  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4937  putative AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
330 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.456473 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1460  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 
152 aa  115  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1231  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 
159 aa  115  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000551227  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2612  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.37 
 
 
349 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2894  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.46 
 
 
349 aa  107  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0895159  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0615  heme d1 biosynthesis protein NirL  40.62 
 
 
174 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0086  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.58 
 
 
371 aa  105  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0344  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
337 aa  104  7e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00313859  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2018  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.78 
 
 
159 aa  104  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2157  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
157 aa  103  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.91704  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0511  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.46 
 
 
346 aa  103  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4037  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 
328 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3179  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 
158 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1976  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 
332 aa  102  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.481877  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2503  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.51 
 
 
166 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1257  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.76 
 
 
155 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192056  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06700  heme d1 biosynthesis protein NirL  41.18 
 
 
174 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0791164  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4224  putative heme biosynthesis protein  35.9 
 
 
372 aa  101  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3127  AsnC family transcriptional regulator  41.74 
 
 
178 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5014  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
327 aa  100  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2996  AsnC family transcriptional regulator  35.26 
 
 
159 aa  100  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3349  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.2 
 
 
337 aa  99.4  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2287  AsnC family transcriptional regulator  36.54 
 
 
351 aa  97.4  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1130  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 
176 aa  95.9  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.853414 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0453  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.17 
 
 
338 aa  95.5  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000254867  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0047  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 
162 aa  94.7  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0361845  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0512  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
341 aa  94.4  7e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2422  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.75 
 
 
161 aa  93.6  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000360306 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1909  AsnC family transcriptional regulator  37.34 
 
 
348 aa  93.2  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1714  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.41 
 
 
348 aa  92  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0219  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 
160 aa  89.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.735917  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1445  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 
338 aa  85.5  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.943985 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2066  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.99 
 
 
359 aa  85.1  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.348008  hitchhiker  0.0096425 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0505  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 
353 aa  84.7  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5931  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.66 
 
 
361 aa  85.1  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.7792  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0693  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 
156 aa  84.7  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0956  AsnC family transcriptional regulator  37.31 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12320  transcriptional regulator  34.19 
 
 
385 aa  81.6  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.601  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3176  nitrite reductase heme biosynthesis D protein  32.05 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1341  AsnC family transcriptional regulator  35.54 
 
 
155 aa  79  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  31.25 
 
 
769 aa  77.8  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1254  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.11 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2491  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
323 aa  74.3  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.635562 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2197  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00194036  normal  0.364618 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2628  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.977143  normal  0.0209854 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3002  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.23 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0877  AsnC family transcriptional regulator  35.4 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173236  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06710  putative transcriptional regulator  33.61 
 
 
150 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179888  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2627  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.29 
 
 
170 aa  61.2  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0212574 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0616  putative transcriptional regulator  32.77 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1342  AsnC family transcriptional regulator  33.85 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1956  putative transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 
165 aa  58.9  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.231554 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1255  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.69 
 
 
173 aa  58.2  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2158  AsnC family transcriptional regulator  25.38 
 
 
153 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.53463  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2394  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.35 
 
 
152 aa  57.4  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1256  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.85 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.387392  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0692  AsnC family transcriptional regulator  27 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0878  AsnC family transcriptional regulator  31.2 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0177181  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2129  AsnC family transcriptional regulator  33 
 
 
176 aa  55.1  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394318  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2198  AsnC family transcriptional regulator  30.25 
 
 
172 aa  54.3  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00973271  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2246  AsnC family transcriptional regulator  32.11 
 
 
323 aa  53.9  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  0.373627 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1708  AsnC family transcriptional regulator  33.04 
 
 
323 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00654875 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1222  putative transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 
327 aa  53.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2578  AsnC family transcriptional regulator  28.43 
 
 
164 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1232  AsnC family transcriptional regulator  29.91 
 
 
151 aa  53.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000917912  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0957  AsnC family transcriptional regulator  33.06 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0013  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 
321 aa  52.4  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000293296  normal  0.0126394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1459  AsnC family transcriptional regulator  28.23 
 
 
182 aa  51.6  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0044  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
332 aa  51.6  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.268461  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0962  AsnC family transcriptional regulator  34.19 
 
 
322 aa  50.8  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.571479  hitchhiker  0.00125709 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3175  nitrite reductase heme biosynthesis G  29.06 
 
 
149 aa  49.7  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1129  putative transcriptional regulator, AsnC family  22.55 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.875514 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1908  AsnC family transcriptional regulator  30.28 
 
 
160 aa  48.9  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1713  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.28 
 
 
160 aa  48.9  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259124  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0464  AsnC family transcriptional regulator  31 
 
 
150 aa  48.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000584146  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4225  putative heme biosynthesis protein  24.62 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2081  AsnC family transcriptional regulator  30.33 
 
 
149 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566316  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1134  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 
149 aa  46.6  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0641869  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0150  AsnC family transcriptional regulator  24.58 
 
 
321 aa  46.6  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.587546  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2900  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.43 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179211 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>