113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1976 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1976  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
332 aa  684    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.481877  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0453  putative transcriptional regulator, AsnC family  54.46 
 
 
338 aa  363  2e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000254867  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0505  AsnC family transcriptional regulator  45.81 
 
 
353 aa  319  3e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5931  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.35 
 
 
361 aa  305  7e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.7792  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2287  AsnC family transcriptional regulator  41.69 
 
 
351 aa  292  5e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0512  AsnC family transcriptional regulator  45.96 
 
 
341 aa  285  5.999999999999999e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0344  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.24 
 
 
337 aa  267  2e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00313859  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4037  AsnC family transcriptional regulator  36.92 
 
 
328 aa  249  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3349  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.05 
 
 
337 aa  227  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2066  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.82 
 
 
359 aa  217  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.348008  hitchhiker  0.0096425 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2894  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.36 
 
 
349 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0895159  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0074  AsnC family transcriptional regulator  28.4 
 
 
334 aa  168  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1585  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.86 
 
 
345 aa  167  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208973  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  29.75 
 
 
769 aa  166  6.9999999999999995e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0511  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.88 
 
 
346 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12320  transcriptional regulator  28.91 
 
 
385 aa  160  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.601  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4937  putative AsnC family transcriptional regulator  29.19 
 
 
330 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.456473 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4224  putative heme biosynthesis protein  30.21 
 
 
372 aa  157  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3269  AsnC family transcriptional regulator  28.3 
 
 
322 aa  155  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.764297  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3176  nitrite reductase heme biosynthesis D protein  29.78 
 
 
331 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2612  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.66 
 
 
349 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.11 
 
 
360 aa  152  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2491  AsnC family transcriptional regulator  29.03 
 
 
323 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.635562 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0086  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.14 
 
 
371 aa  150  4e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1221  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.74 
 
 
363 aa  149  6e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5014  AsnC family transcriptional regulator  28.13 
 
 
327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2130  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.61 
 
 
361 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.826373  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1909  AsnC family transcriptional regulator  25.23 
 
 
348 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1614  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.2 
 
 
359 aa  143  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000928597  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1708  AsnC family transcriptional regulator  29.15 
 
 
323 aa  139  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00654875 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1714  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.62 
 
 
348 aa  139  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0044  AsnC family transcriptional regulator  28.94 
 
 
332 aa  139  7e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.268461  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1445  AsnC family transcriptional regulator  27.99 
 
 
338 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.943985 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0962  AsnC family transcriptional regulator  28.62 
 
 
322 aa  136  4e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.571479  hitchhiker  0.00125709 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2996  AsnC family transcriptional regulator  41.03 
 
 
159 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2246  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 
323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  0.373627 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1130  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.06 
 
 
176 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.853414 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1222  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.48 
 
 
327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2198  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
172 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00973271  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0150  AsnC family transcriptional regulator  28.93 
 
 
321 aa  125  8.000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.587546  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1129  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.29 
 
 
156 aa  123  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.875514 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1257  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 
155 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192056  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1460  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
152 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2157  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 
157 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.91704  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2422  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.48 
 
 
161 aa  120  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000360306 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2158  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 
153 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.53463  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0047  AsnC family transcriptional regulator  41.43 
 
 
162 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0361845  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0013  AsnC family transcriptional regulator  27.16 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000293296  normal  0.0126394 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1231  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 
159 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000551227  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4226  putative heme biosythesis protein  40.31 
 
 
183 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0464  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
150 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000584146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1256  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 
155 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.387392  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5016  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 
166 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380949  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2197  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 
160 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00194036  normal  0.364618 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1342  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
157 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1255  putative transcriptional regulator, AsnC family  34 
 
 
173 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0286  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.96 
 
 
173 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3179  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
158 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3267  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 
158 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381934  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1232  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000917912  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2018  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.69 
 
 
159 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0692  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 
156 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0072  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 
166 aa  110  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.598742  normal  0.790433 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1907  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 
160 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1254  putative transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 
161 aa  109  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3174  putative nitrite reductase heme biosynthesis H protein  38.1 
 
 
161 aa  109  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1341  AsnC family transcriptional regulator  31.72 
 
 
155 aa  109  7.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2493  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 
160 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1712  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.78 
 
 
160 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0693  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 
156 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1956  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.85 
 
 
165 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.231554 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2900  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.01 
 
 
165 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179211 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0219  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 
160 aa  106  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.735917  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06680  hypothetical protein  36.05 
 
 
171 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00214108  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1134  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 
149 aa  105  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0641869  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2503  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.24 
 
 
166 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2578  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
164 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0956  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 
162 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0878  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
164 aa  103  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0177181  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0613  hypothetical protein  34.69 
 
 
171 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2129  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 
176 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394318  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2627  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.79 
 
 
170 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0212574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1459  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 
182 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2610  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.12 
 
 
189 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3002  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.05 
 
 
156 aa  99.4  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1447  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 
160 aa  99  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.836924 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3129  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
173 aa  98.2  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2394  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.9 
 
 
152 aa  96.7  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2628  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.87 
 
 
162 aa  95.5  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.977143  normal  0.0209854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0615  heme d1 biosynthesis protein NirL  34.27 
 
 
174 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0957  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
165 aa  95.1  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06700  heme d1 biosynthesis protein NirL  32.87 
 
 
174 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0791164  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3127  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
178 aa  89.4  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3175  nitrite reductase heme biosynthesis G  34.65 
 
 
149 aa  89  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2611  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.15 
 
 
167 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.672357  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3128  AsnC family transcriptional regulator  32.81 
 
 
166 aa  84  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2081  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566316  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4225  putative heme biosynthesis protein  28.97 
 
 
170 aa  81.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0877  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 
164 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173236  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06710  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 
150 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179888  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>