110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3174 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3174  putative nitrite reductase heme biosynthesis H protein  100 
 
 		 161 aa  327  4e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3267  AsnC family transcriptional regulator  66.88 
 
 		 158 aa  223  9e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2493  AsnC family transcriptional regulator  67.52 
 
 		 160 aa  215  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0072  AsnC family transcriptional regulator  64.1 
 
 		 166 aa  206  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.598742  normal  0.790433 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3129  AsnC family transcriptional regulator  59.48 
 
 		 173 aa  199  9e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1907  AsnC family transcriptional regulator  62.42 
 
 		 160 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5016  AsnC family transcriptional regulator  63.29 
 
 		 166 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380949  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1712  putative transcriptional regulator, AsnC family  62.42 
 
 		 160 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1447  AsnC family transcriptional regulator  64.78 
 
 		 160 aa  193  8.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.836924 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0613  hypothetical protein  57.24 
 
 		 171 aa  181  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06680  hypothetical protein  57.89 
 
 		 171 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00214108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2610  putative transcriptional regulator, AsnC family  56.41 
 
 		 189 aa  176  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4226  putative heme biosythesis protein  47.95 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.39 
 
 		 360 aa  153  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1221  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.81 
 
 		 363 aa  148  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2130  putative transcriptional regulator, AsnC family  46.79 
 
 		 361 aa  147  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.826373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1231  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000551227  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0074  AsnC family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 334 aa  142  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1614  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.77 
 
 		 359 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000928597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3269  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 322 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.764297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1460  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 152 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2157  AsnC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 157 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.91704  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0512  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 341 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2612  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.59 
 
 		 349 aa  120  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2287  AsnC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 351 aa  119  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4224  putative heme biosynthesis protein  37.93 
 
 		 372 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4937  putative AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 330 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.456473 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1130  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.42 
 
 		 176 aa  118  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.853414 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1257  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.82 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0047  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0361845  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0344  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.35 
 
 		 337 aa  112  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00313859  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3127  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1585  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 		 345 aa  110  7.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3349  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.31 
 
 		 337 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1976  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 332 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.481877  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2894  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.66 
 
 		 349 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0895159  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0615  heme d1 biosynthesis protein NirL  41.55 
 
 		 174 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0086  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.54 
 
 		 371 aa  107  7.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06700  heme d1 biosynthesis protein NirL  43.75 
 
 		 174 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0791164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2996  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5931  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.82 
 
 		 361 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.7792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0505  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 353 aa  105  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1254  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.06 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5014  AsnC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 327 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0511  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.5 
 
 		 346 aa  103  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2197  AsnC family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00194036  normal  0.364618 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3179  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 158 aa  99.8  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4037  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 328 aa  99.4  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0956  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 162 aa  99  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0453  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.47 
 
 		 338 aa  98.6  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000254867  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0219  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 160 aa  97.4  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.735917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2422  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 		 161 aa  96.7  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000360306 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2018  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.24 
 
 		 159 aa  96.3  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1445  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 338 aa  94.7  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.943985 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2503  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.44 
 
 		 166 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3176  nitrite reductase heme biosynthesis D protein  37.18 
 
 		 331 aa  91.7  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1341  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 155 aa  91.7  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2628  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.977143  normal  0.0209854 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2066  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.2 
 
 		 359 aa  91.3  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.348008  hitchhiker  0.0096425 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1909  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 348 aa  90.1  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0877  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173236  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1714  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 348 aa  89.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12320  transcriptional regulator  32.52 
 
 		 385 aa  87.4  7e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0693  AsnC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2491  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 323 aa  81.3  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.635562 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3002  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  36.53 
 
 		 769 aa  75.9  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0878  AsnC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0177181  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2246  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 323 aa  71.6  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  0.373627 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0286  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06710  putative transcriptional regulator  33.83 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0616  putative transcriptional regulator  33.83 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2578  AsnC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1708  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00654875 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2158  AsnC family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 153 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.53463  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0464  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000584146  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1129  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.95 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.875514 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1956  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.32 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.231554 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0150  AsnC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 321 aa  62.4  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.587546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3175  nitrite reductase heme biosynthesis G  32.33 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0044  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.268461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2129  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1134  AsnC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0641869  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0692  AsnC family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1459  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0957  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2900  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.62 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179211 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2394  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.89 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2627  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.66 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0212574 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1256  putative transcriptional regulator, AsnC family  24.67 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.387392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1232  AsnC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000917912  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1255  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1342  AsnC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1222  putative transcriptional regulator, AsnC family  22.97 
 
 		 327 aa  54.7  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3126  AsnC family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0962  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 322 aa  54.7  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.571479  hitchhiker  0.00125709 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2198  AsnC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00973271  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0073  AsnC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.302073  normal  0.744258 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3128  AsnC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 166 aa  51.2  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2081  AsnC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566316  normal  0.275605 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>