115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2996 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2996  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  328  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3349  putative transcriptional regulator, AsnC family  52.6 
 
 		 337 aa  174  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1254  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.57 
 
 		 161 aa  172  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1341  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2157  AsnC family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.91704  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1130  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.21 
 
 		 176 aa  165  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.853414 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1257  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.29 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2422  putative transcriptional regulator, AsnC family  47.4 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000360306 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1460  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 152 aa  152  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0047  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0361845  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2197  AsnC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 160 aa  148  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00194036  normal  0.364618 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1231  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000551227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0693  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 156 aa  146  9e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0512  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 341 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0505  AsnC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 353 aa  144  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2018  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.58 
 
 		 159 aa  143  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3002  putative transcriptional regulator, AsnC family  46.1 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3179  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4037  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 328 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5931  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.28 
 
 		 361 aa  137  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.7792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1976  AsnC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 332 aa  135  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.481877  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2503  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.03 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0344  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.85 
 
 		 337 aa  134  5e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00313859  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0956  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0219  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.735917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3267  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0453  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.06 
 
 		 338 aa  121  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000254867  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0072  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 166 aa  119  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.598742  normal  0.790433 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2287  AsnC family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 351 aa  119  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0877  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173236  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12320  transcriptional regulator  39.05 
 
 		 385 aa  116  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0074  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 334 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2612  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.88 
 
 		 349 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2610  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.37 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3127  AsnC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 178 aa  113  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2628  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.72 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.977143  normal  0.0209854 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2066  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.32 
 
 		 359 aa  110  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.348008  hitchhiker  0.0096425 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1907  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1712  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.18 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2493  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 160 aa  107  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3174  putative nitrite reductase heme biosynthesis H protein  36.77 
 
 		 161 aa  107  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5016  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 166 aa  104  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380949  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1614  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.97 
 
 		 359 aa  103  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000928597  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4224  putative heme biosynthesis protein  33.12 
 
 		 372 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4226  putative heme biosythesis protein  37.5 
 
 		 183 aa  101  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1909  AsnC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 348 aa  100  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0613  hypothetical protein  35.26 
 
 		 171 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3176  nitrite reductase heme biosynthesis D protein  34 
 
 		 331 aa  100  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2130  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.25 
 
 		 361 aa  100  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.826373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06680  hypothetical protein  35.9 
 
 		 171 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00214108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3269  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 322 aa  99.4  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.764297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1445  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 338 aa  99.4  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.943985 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1447  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 160 aa  99  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.836924 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1714  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.19 
 
 		 348 aa  97.8  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3129  AsnC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 173 aa  97.1  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2894  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.64 
 
 		 349 aa  95.9  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0895159  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5014  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 327 aa  95.5  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1585  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.87 
 
 		 345 aa  95.5  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.76 
 
 		 360 aa  92  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1221  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.96 
 
 		 363 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4937  putative AsnC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 330 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.456473 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0086  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.87 
 
 		 371 aa  87.4  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0615  heme d1 biosynthesis protein NirL  33.33 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  36.94 
 
 		 769 aa  80.9  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1255  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.29 
 
 		 173 aa  80.9  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06700  heme d1 biosynthesis protein NirL  30 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0791164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2491  AsnC family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.635562 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1256  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.81 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.387392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1708  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 323 aa  77.4  0.00000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00654875 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0878  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0177181  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0511  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.37 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0692  AsnC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2246  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 323 aa  75.5  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  0.373627 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0013  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 321 aa  75.1  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000293296  normal  0.0126394 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1342  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1222  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.67 
 
 		 327 aa  74.3  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2158  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.53463  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1129  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.61 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.875514 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0464  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000584146  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2627  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.21 
 
 		 170 aa  70.5  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0212574 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2198  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00973271  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0150  AsnC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 321 aa  67.8  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.587546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0957  AsnC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 165 aa  67  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1713  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.13 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259124  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1459  AsnC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1232  AsnC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000917912  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0044  AsnC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.268461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2611  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.53 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.672357  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1134  AsnC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0641869  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4225  putative heme biosynthesis protein  32.2 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1908  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2081  AsnC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566316  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3268  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.573654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3128  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0962  AsnC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 322 aa  61.6  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.571479  hitchhiker  0.00125709 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2578  AsnC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06710  putative transcriptional regulator  29.82 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0616  putative transcriptional regulator  29.82 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0286  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.32 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5015  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>