127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3002 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3002  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
156 aa  329  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2422  putative transcriptional regulator, AsnC family  67.1 
 
 
161 aa  224  5.0000000000000005e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000360306 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3179  AsnC family transcriptional regulator  56.77 
 
 
158 aa  180  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0219  AsnC family transcriptional regulator  54.49 
 
 
160 aa  173  7e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.735917  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2503  putative transcriptional regulator, AsnC family  52.26 
 
 
166 aa  167  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2018  putative transcriptional regulator, AsnC family  52.53 
 
 
159 aa  166  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3349  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.3 
 
 
337 aa  156  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2996  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 
159 aa  152  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1130  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.81 
 
 
176 aa  148  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.853414 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2157  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 
157 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.91704  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0693  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
156 aa  140  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1231  AsnC family transcriptional regulator  42.36 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000551227  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0047  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
162 aa  136  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0361845  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1460  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
152 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1341  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 
155 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1257  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.96 
 
 
155 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192056  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4037  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 
328 aa  128  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0505  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 
353 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1254  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.6 
 
 
161 aa  123  9e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2197  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 
160 aa  122  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00194036  normal  0.364618 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0512  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 
341 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12320  transcriptional regulator  35.98 
 
 
385 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.601  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2287  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0074  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
334 aa  110  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1976  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 
332 aa  107  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.481877  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2066  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.94 
 
 
359 aa  107  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.348008  hitchhiker  0.0096425 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0453  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.85 
 
 
338 aa  105  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000254867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5931  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.41 
 
 
361 aa  104  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.7792  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3269  AsnC family transcriptional regulator  32.91 
 
 
322 aa  103  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.764297  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0956  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 
162 aa  103  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1585  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.62 
 
 
345 aa  102  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208973  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4224  putative heme biosynthesis protein  36.49 
 
 
372 aa  101  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0877  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 
164 aa  100  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173236  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1221  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.8 
 
 
363 aa  99  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0086  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.26 
 
 
371 aa  98.2  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.95 
 
 
360 aa  98.2  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0344  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.46 
 
 
337 aa  94  7e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00313859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5016  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 
166 aa  93.6  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380949  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4226  putative heme biosythesis protein  34.5 
 
 
183 aa  92.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2894  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 
349 aa  92.8  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0895159  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1445  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 
338 aa  92.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.943985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2628  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.51 
 
 
162 aa  92.4  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.977143  normal  0.0209854 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2130  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 
361 aa  91.7  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.826373  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3127  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
178 aa  91.3  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06700  heme d1 biosynthesis protein NirL  32.88 
 
 
174 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0791164  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0615  heme d1 biosynthesis protein NirL  32.88 
 
 
174 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3267  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381934  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3174  putative nitrite reductase heme biosynthesis H protein  33.57 
 
 
161 aa  87.8  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2612  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.03 
 
 
349 aa  87.8  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3176  nitrite reductase heme biosynthesis D protein  33.11 
 
 
331 aa  87  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0511  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.03 
 
 
346 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0072  AsnC family transcriptional regulator  31.45 
 
 
166 aa  85.5  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.598742  normal  0.790433 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1907  AsnC family transcriptional regulator  30.57 
 
 
160 aa  85.5  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1712  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.94 
 
 
160 aa  84.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06680  hypothetical protein  34.9 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00214108  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1614  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.75 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000928597  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3129  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0613  hypothetical protein  34.23 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2610  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  34.94 
 
 
769 aa  79.3  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2493  AsnC family transcriptional regulator  29.14 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1447  AsnC family transcriptional regulator  29.3 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.836924 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4937  putative AsnC family transcriptional regulator  32.41 
 
 
330 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.456473 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5014  AsnC family transcriptional regulator  27.22 
 
 
327 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0692  AsnC family transcriptional regulator  27.86 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1909  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
348 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1714  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.08 
 
 
348 aa  70.5  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1459  AsnC family transcriptional regulator  27.41 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1255  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 
173 aa  67.4  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1232  AsnC family transcriptional regulator  26.67 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000917912  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2627  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.69 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0212574 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1222  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 
327 aa  65.5  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2198  AsnC family transcriptional regulator  30.95 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00973271  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2246  AsnC family transcriptional regulator  30.08 
 
 
323 aa  64.7  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  0.373627 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1342  AsnC family transcriptional regulator  29.14 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0013  AsnC family transcriptional regulator  28.37 
 
 
321 aa  64.3  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000293296  normal  0.0126394 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2491  AsnC family transcriptional regulator  26.52 
 
 
323 aa  63.9  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.635562 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1256  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.21 
 
 
155 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.387392  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2158  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.53463  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2394  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.6 
 
 
152 aa  58.2  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1708  AsnC family transcriptional regulator  30.08 
 
 
323 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00654875 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2578  AsnC family transcriptional regulator  28.89 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2900  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.05 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179211 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0044  AsnC family transcriptional regulator  27.82 
 
 
332 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.268461  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0962  AsnC family transcriptional regulator  28.15 
 
 
322 aa  56.2  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.571479  hitchhiker  0.00125709 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0286  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.52 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0464  AsnC family transcriptional regulator  25.5 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000584146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06710  putative transcriptional regulator  29.77 
 
 
150 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179888  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0616  putative transcriptional regulator  29.77 
 
 
150 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4225  putative heme biosynthesis protein  28.68 
 
 
170 aa  54.3  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1134  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
149 aa  53.9  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0641869  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1956  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.37 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.231554 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3128  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0150  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
321 aa  52.4  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.587546  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3126  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  29.01 
 
 
178 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2492  AsnC family transcriptional regulator  23.53 
 
 
157 aa  47.4  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.614056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.41 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  27.27 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2047  transcriptional regulator, AsnC family  27.89 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>