147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0286 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0286  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
173 aa  358  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2129  AsnC family transcriptional regulator  67.27 
 
 
176 aa  236  9e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394318  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2578  AsnC family transcriptional regulator  69.54 
 
 
164 aa  227  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2900  putative transcriptional regulator, AsnC family  60.61 
 
 
165 aa  213  9e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179211 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2394  putative transcriptional regulator, AsnC family  63.09 
 
 
152 aa  209  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1956  putative transcriptional regulator, AsnC family  62.91 
 
 
165 aa  203  8e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.231554 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0464  AsnC family transcriptional regulator  52.7 
 
 
150 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000584146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1256  putative transcriptional regulator, AsnC family  47.65 
 
 
155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.387392  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2198  AsnC family transcriptional regulator  52.11 
 
 
172 aa  159  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00973271  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1342  AsnC family transcriptional regulator  49.32 
 
 
157 aa  157  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2158  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 
153 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.53463  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3349  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.03 
 
 
337 aa  154  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0692  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
156 aa  154  8e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  47.86 
 
 
769 aa  150  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1129  putative transcriptional regulator, AsnC family  46.98 
 
 
156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.875514 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1255  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.79 
 
 
173 aa  140  9e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12320  transcriptional regulator  48.41 
 
 
385 aa  136  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.601  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1459  AsnC family transcriptional regulator  40.38 
 
 
182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1232  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000917912  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0878  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0177181  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3126  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
154 aa  124  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5931  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.36 
 
 
361 aa  123  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.7792  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2066  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.55 
 
 
359 aa  119  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.348008  hitchhiker  0.0096425 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4037  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 
328 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4225  putative heme biosynthesis protein  31.21 
 
 
170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1976  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 
332 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.481877  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0512  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 
341 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0511  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.58 
 
 
346 aa  110  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2081  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566316  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2287  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 
351 aa  110  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0505  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
353 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0086  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.31 
 
 
371 aa  108  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2894  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.24 
 
 
349 aa  108  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0895159  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3175  nitrite reductase heme biosynthesis G  38.96 
 
 
149 aa  108  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0073  AsnC family transcriptional regulator  32.65 
 
 
147 aa  108  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.302073  normal  0.744258 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3269  AsnC family transcriptional regulator  42.57 
 
 
322 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.764297  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1134  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 
149 aa  106  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0641869  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0074  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 
334 aa  105  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3176  nitrite reductase heme biosynthesis D protein  37.58 
 
 
331 aa  104  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1909  AsnC family transcriptional regulator  35.19 
 
 
348 aa  104  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1585  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.57 
 
 
345 aa  103  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208973  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2491  AsnC family transcriptional regulator  40.6 
 
 
323 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.635562 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1714  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.19 
 
 
348 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0453  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.1 
 
 
338 aa  101  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000254867  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5015  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 
151 aa  101  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330876  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2492  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 
157 aa  100  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.614056 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2611  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.32 
 
 
167 aa  100  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.672357  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2627  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 
170 aa  100  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0212574 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0616  putative transcriptional regulator  34.46 
 
 
150 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06710  putative transcriptional regulator  34.46 
 
 
150 aa  99  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179888  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3268  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
152 aa  98.6  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.573654  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2612  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.69 
 
 
349 aa  98.2  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1713  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 
160 aa  98.2  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259124  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1908  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 
160 aa  97.8  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1221  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.18 
 
 
363 aa  96.3  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0044  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 
332 aa  94.7  5e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.268461  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0957  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 
165 aa  94.7  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3128  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
166 aa  94.7  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1708  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
323 aa  93.2  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00654875 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0150  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
321 aa  91.3  7e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.587546  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0614  putative transcriptional regulator  34.48 
 
 
147 aa  90.5  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2246  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 
323 aa  89.4  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  0.373627 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.32 
 
 
360 aa  89  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06690  putative transcriptional regulator  33.79 
 
 
147 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0225881  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1446  AsnC family transcriptional regulator  34.53 
 
 
163 aa  88.6  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.855842 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0962  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 
322 aa  86.3  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.571479  hitchhiker  0.00125709 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4224  putative heme biosynthesis protein  30.32 
 
 
372 aa  85.5  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0344  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.12 
 
 
337 aa  85.5  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00313859  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4937  putative AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 
330 aa  84.7  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.456473 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1614  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 
359 aa  84  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000928597  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0047  AsnC family transcriptional regulator  34.59 
 
 
162 aa  84  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0361845  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1231  AsnC family transcriptional regulator  30.61 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000551227  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2130  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 
361 aa  81.6  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.826373  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1222  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5014  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 
327 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1254  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.08 
 
 
161 aa  77.4  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0956  AsnC family transcriptional regulator  33.54 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1460  AsnC family transcriptional regulator  30.08 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0693  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2157  AsnC family transcriptional regulator  28.39 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.91704  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3267  AsnC family transcriptional regulator  34.15 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381934  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3174  putative nitrite reductase heme biosynthesis H protein  35.71 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1257  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.5 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192056  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0013  AsnC family transcriptional regulator  36.44 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000293296  normal  0.0126394 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1445  AsnC family transcriptional regulator  32.61 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.943985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5016  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380949  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0072  AsnC family transcriptional regulator  30.08 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.598742  normal  0.790433 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1907  AsnC family transcriptional regulator  31.15 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3127  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 
178 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1341  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 
155 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1712  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.33 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1447  AsnC family transcriptional regulator  32.79 
 
 
160 aa  61.6  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.836924 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1130  putative transcriptional regulator, AsnC family  23.29 
 
 
176 aa  61.6  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.853414 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0877  AsnC family transcriptional regulator  27.82 
 
 
164 aa  60.8  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173236  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3129  AsnC family transcriptional regulator  30.33 
 
 
173 aa  60.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2493  AsnC family transcriptional regulator  32.5 
 
 
160 aa  59.7  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2628  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.38 
 
 
162 aa  59.3  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.977143  normal  0.0209854 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3179  AsnC family transcriptional regulator  29.23 
 
 
158 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2503  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 
166 aa  58.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2610  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.35 
 
 
189 aa  58.5  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>