104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1713 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1713  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
160 aa  322  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259124  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1908  AsnC family transcriptional regulator  99.38 
 
 
160 aa  321  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1446  AsnC family transcriptional regulator  73.47 
 
 
163 aa  200  8e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.855842 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2611  putative transcriptional regulator, AsnC family  60.99 
 
 
167 aa  171  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.672357  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3268  AsnC family transcriptional regulator  58.62 
 
 
152 aa  160  8.000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.573654  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0073  AsnC family transcriptional regulator  51.06 
 
 
147 aa  149  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.302073  normal  0.744258 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2081  AsnC family transcriptional regulator  51.41 
 
 
149 aa  147  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566316  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4225  putative heme biosynthesis protein  48.63 
 
 
170 aa  145  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06690  putative transcriptional regulator  54.93 
 
 
147 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0225881  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0614  putative transcriptional regulator  54.93 
 
 
147 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3175  nitrite reductase heme biosynthesis G  49.66 
 
 
149 aa  142  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3128  AsnC family transcriptional regulator  48.25 
 
 
166 aa  141  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5015  AsnC family transcriptional regulator  49.3 
 
 
151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330876  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2492  AsnC family transcriptional regulator  46.21 
 
 
157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.614056 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1585  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.25 
 
 
345 aa  120  7e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208973  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1614  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.95 
 
 
359 aa  120  8e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000928597  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0511  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.82 
 
 
346 aa  117  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2894  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.85 
 
 
349 aa  117  9e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0895159  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 
360 aa  114  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06710  putative transcriptional regulator  41.43 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179888  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1221  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.63 
 
 
363 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0616  putative transcriptional regulator  41.43 
 
 
150 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0074  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 
334 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4224  putative heme biosynthesis protein  39.01 
 
 
372 aa  107  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2130  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.23 
 
 
361 aa  106  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.826373  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3126  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
154 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0086  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.18 
 
 
371 aa  105  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  38.13 
 
 
769 aa  105  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1256  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 
155 aa  103  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.387392  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1909  AsnC family transcriptional regulator  42.22 
 
 
348 aa  102  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1714  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.22 
 
 
348 aa  101  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3269  AsnC family transcriptional regulator  44.72 
 
 
322 aa  100  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.764297  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2158  AsnC family transcriptional regulator  34.68 
 
 
153 aa  100  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.53463  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1232  AsnC family transcriptional regulator  34.09 
 
 
151 aa  100  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000917912  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1342  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 
157 aa  99  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2394  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.53 
 
 
152 aa  98.6  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1956  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.08 
 
 
165 aa  99  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.231554 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0286  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 
173 aa  98.2  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2578  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 
164 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1134  AsnC family transcriptional regulator  37.88 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0641869  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2129  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 
176 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394318  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1255  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 
173 aa  92.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1459  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
182 aa  92  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0692  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 
156 aa  92  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0464  AsnC family transcriptional regulator  35.94 
 
 
150 aa  91.7  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000584146  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2491  AsnC family transcriptional regulator  41.98 
 
 
323 aa  90.9  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.635562 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2612  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.61 
 
 
349 aa  89  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2900  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.47 
 
 
165 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179211 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2198  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 
172 aa  87.4  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00973271  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3176  nitrite reductase heme biosynthesis D protein  39.68 
 
 
331 aa  87  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1129  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.68 
 
 
156 aa  85.5  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.875514 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1708  AsnC family transcriptional regulator  41.44 
 
 
323 aa  84.3  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00654875 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2246  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 
323 aa  84  8e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  0.373627 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0957  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0512  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
341 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3349  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.06 
 
 
337 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2627  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.32 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0212574 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0044  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.268461  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4937  putative AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 
330 aa  78.2  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.456473 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5014  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
327 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0962  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.571479  hitchhiker  0.00125709 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2287  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 
351 aa  72.4  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1976  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
332 aa  72.4  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.481877  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0878  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
164 aa  72  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0177181  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4037  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
328 aa  70.9  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1341  AsnC family transcriptional regulator  32.85 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5931  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.96 
 
 
361 aa  68.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.7792  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2066  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.09 
 
 
359 aa  67.4  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.348008  hitchhiker  0.0096425 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2996  AsnC family transcriptional regulator  30.13 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0150  AsnC family transcriptional regulator  33.91 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.587546  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1445  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 
338 aa  67  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.943985 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1222  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.55 
 
 
327 aa  65.5  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12320  transcriptional regulator  31.54 
 
 
385 aa  65.5  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.601  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0344  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.39 
 
 
337 aa  64.3  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00313859  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0505  AsnC family transcriptional regulator  28.44 
 
 
353 aa  63.9  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0047  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 
162 aa  62.4  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0361845  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2422  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.66 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000360306 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1231  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 
159 aa  60.8  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000551227  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3267  AsnC family transcriptional regulator  35.78 
 
 
158 aa  60.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381934  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1257  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.53 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192056  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1460  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 
152 aa  59.7  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0453  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.02 
 
 
338 aa  58.2  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000254867  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1254  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.67 
 
 
161 aa  57.8  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2493  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2157  AsnC family transcriptional regulator  28.26 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.91704  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0013  AsnC family transcriptional regulator  27.43 
 
 
321 aa  55.1  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000293296  normal  0.0126394 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5016  AsnC family transcriptional regulator  36.54 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380949  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1907  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2610  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 
189 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1712  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.92 
 
 
160 aa  52.4  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1130  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.35 
 
 
176 aa  52  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.853414 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0956  AsnC family transcriptional regulator  29.25 
 
 
162 aa  50.8  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0072  AsnC family transcriptional regulator  31.48 
 
 
166 aa  50.4  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.598742  normal  0.790433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0613  hypothetical protein  30.28 
 
 
171 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06680  hypothetical protein  31.19 
 
 
171 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00214108  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1447  AsnC family transcriptional regulator  33.98 
 
 
160 aa  48.1  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.836924 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0693  AsnC family transcriptional regulator  23.7 
 
 
156 aa  47.8  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3174  putative nitrite reductase heme biosynthesis H protein  34.95 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2018  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
159 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3127  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 
178 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>