114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3176 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3176  nitrite reductase heme biosynthesis D protein  100 
 
 		 331 aa  669    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2491  AsnC family transcriptional regulator  56.17 
 
 		 323 aa  322  5e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.635562 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0074  AsnC family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 334 aa  255  7e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3269  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.764297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2612  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.34 
 
 		 349 aa  230  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1909  AsnC family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 348 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4937  putative AsnC family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 330 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.456473 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1714  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.95 
 
 		 348 aa  210  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1445  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 338 aa  209  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.943985 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1585  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.65 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2894  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.86 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0895159  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5014  AsnC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 327 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0511  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 346 aa  193  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4224  putative heme biosynthesis protein  32.63 
 
 		 372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0086  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.98 
 
 		 371 aa  189  5e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2066  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.34 
 
 		 359 aa  174  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.348008  hitchhiker  0.0096425 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0512  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1221  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.38 
 
 		 363 aa  170  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3349  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.12 
 
 		 337 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.94 
 
 		 360 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0344  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.34 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00313859  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4037  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 328 aa  159  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1614  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.54 
 
 		 359 aa  158  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000928597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2287  AsnC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5931  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.67 
 
 		 361 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.7792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0505  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 353 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2130  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.88 
 
 		 361 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.826373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0453  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.99 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000254867  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1976  AsnC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.481877  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12320  transcriptional regulator  29.44 
 
 		 385 aa  141  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3126  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 154 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06710  putative transcriptional regulator  43.84 
 
 		 150 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0616  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 150 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2246  AsnC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  0.373627 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1708  AsnC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00654875 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  29.19 
 
 		 769 aa  123  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0044  AsnC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 332 aa  119  7e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.268461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3127  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 178 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2157  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 157 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.91704  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0047  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 162 aa  112  9e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0361845  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06700  heme d1 biosynthesis protein NirL  41.83 
 
 		 174 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0791164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0615  heme d1 biosynthesis protein NirL  41.83 
 
 		 174 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0962  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.571479  hitchhiker  0.00125709 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0072  AsnC family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 166 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.598742  normal  0.790433 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2198  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 172 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00973271  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1460  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 152 aa  109  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2394  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 		 152 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1231  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 159 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000551227  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1907  AsnC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 160 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0692  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 156 aa  106  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1712  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 		 160 aa  107  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5016  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 166 aa  106  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380949  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3267  AsnC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 158 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0286  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.58 
 
 		 173 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1257  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.49 
 
 		 155 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1254  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.22 
 
 		 161 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0150  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.587546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0877  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 164 aa  103  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1459  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 182 aa  102  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2900  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.93 
 
 		 165 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179211 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1256  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 		 155 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.387392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2996  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 159 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0464  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 150 aa  100  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000584146  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1222  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.53 
 
 		 327 aa  99.8  6e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1130  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 		 176 aa  99.4  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.853414 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2503  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.53 
 
 		 166 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0073  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 147 aa  99  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.302073  normal  0.744258 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1232  AsnC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 151 aa  97.4  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000917912  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0219  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 160 aa  95.9  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.735917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0956  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 162 aa  95.9  8e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2422  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.01 
 
 		 161 aa  95.5  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000360306 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1341  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 155 aa  95.5  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2197  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 160 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00194036  normal  0.364618 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1255  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.69 
 
 		 173 aa  94  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1956  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.86 
 
 		 165 aa  93.2  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.231554 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2493  AsnC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 160 aa  93.2  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2578  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 164 aa  92.4  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1447  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 160 aa  92.8  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.836924 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2628  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.42 
 
 		 162 aa  92.8  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.977143  normal  0.0209854 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2018  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.43 
 
 		 159 aa  92.4  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0693  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 156 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3174  putative nitrite reductase heme biosynthesis H protein  37.18 
 
 		 161 aa  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5015  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 151 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330876  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0614  putative transcriptional regulator  38.62 
 
 		 147 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2158  AsnC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 153 aa  89.7  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.53463  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2610  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.53 
 
 		 189 aa  89.7  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1129  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.29 
 
 		 156 aa  89.4  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.875514 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3179  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 158 aa  89.4  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4225  putative heme biosynthesis protein  31.91 
 
 		 170 aa  89  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3129  AsnC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 173 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06690  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 		 147 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0225881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2129  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 176 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1446  AsnC family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 163 aa  87.8  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.855842 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2081  AsnC family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 149 aa  87.4  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566316  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1713  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.68 
 
 		 160 aa  87  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259124  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1908  AsnC family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 160 aa  86.3  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3128  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 166 aa  85.5  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3175  nitrite reductase heme biosynthesis G  40.16 
 
 		 149 aa  85.9  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0957  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 165 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2611  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.672357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>