More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0693 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0693  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2996  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 159 aa  146  9e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1341  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1130  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.95 
 
 		 176 aa  145  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.853414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3349  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.58 
 
 		 337 aa  140  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1257  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3002  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2422  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000360306 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2157  AsnC family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.91704  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1231  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000551227  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0505  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 353 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3179  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0453  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 		 338 aa  121  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000254867  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0047  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0361845  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1254  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.06 
 
 		 161 aa  120  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0512  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 341 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1460  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2197  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00194036  normal  0.364618 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2503  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.42 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2018  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5931  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.42 
 
 		 361 aa  115  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.7792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0219  AsnC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.735917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4037  AsnC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 328 aa  108  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0344  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.97 
 
 		 337 aa  107  6e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00313859  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1976  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 332 aa  107  7.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.481877  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2287  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 351 aa  104  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2066  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.75 
 
 		 359 aa  102  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.348008  hitchhiker  0.0096425 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0956  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0877  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 164 aa  97.4  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173236  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12320  transcriptional regulator  33.75 
 
 		 385 aa  95.5  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0072  AsnC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 166 aa  94.7  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.598742  normal  0.790433 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2628  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.78 
 
 		 162 aa  94  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.977143  normal  0.0209854 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3267  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 158 aa  94  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0074  AsnC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 334 aa  93.2  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4226  putative heme biosythesis protein  34.17 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3176  nitrite reductase heme biosynthesis D protein  35.29 
 
 		 331 aa  91.7  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3127  AsnC family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 178 aa  90.9  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2491  AsnC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 323 aa  88.6  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.635562 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4224  putative heme biosynthesis protein  32 
 
 		 372 aa  87.4  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1712  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.94 
 
 		 160 aa  87  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1232  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000917912  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2627  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.09 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0212574 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2612  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.03 
 
 		 349 aa  85.1  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5016  AsnC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 166 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380949  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1907  AsnC family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 160 aa  84.7  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0613  hypothetical protein  31.21 
 
 		 171 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06680  hypothetical protein  31.85 
 
 		 171 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00214108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0692  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 156 aa  84  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1585  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.33 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3174  putative nitrite reductase heme biosynthesis H protein  29.11 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1134  AsnC family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0641869  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2493  AsnC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1459  AsnC family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0615  heme d1 biosynthesis protein NirL  32.92 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4937  putative AsnC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 330 aa  81.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.456473 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  33.72 
 
 		 769 aa  81.3  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2610  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.59 
 
 		 189 aa  80.9  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1129  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.12 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.875514 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2894  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 		 349 aa  80.5  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0895159  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2158  AsnC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.53463  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3269  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.764297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1342  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1256  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.5 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.387392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1447  AsnC family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.836924 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3129  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06700  heme d1 biosynthesis protein NirL  32.3 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0791164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1445  AsnC family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 338 aa  78.2  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.943985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5014  AsnC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 327 aa  78.2  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0086  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.85 
 
 		 371 aa  75.9  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1255  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.47 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0464  AsnC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000584146  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1909  AsnC family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0286  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1222  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.67 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0511  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.69 
 
 		 346 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0878  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0177181  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1714  putative transcriptional regulator, AsnC family  23.57 
 
 		 348 aa  72  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0616  putative transcriptional regulator  30.83 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06710  putative transcriptional regulator  30.83 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0957  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3126  AsnC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2130  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.81 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.826373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1614  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.27 
 
 		 359 aa  68.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000928597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2198  AsnC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00973271  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.06 
 
 		 360 aa  65.5  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0013  AsnC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 321 aa  65.1  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000293296  normal  0.0126394 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2129  AsnC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1956  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.32 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.231554 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2900  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179211 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2492  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.614056 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1221  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.12 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2578  AsnC family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2394  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.32 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2246  AsnC family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  0.373627 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2611  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.87 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.672357  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0150  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 321 aa  53.9  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.587546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  24.8 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4225  putative heme biosynthesis protein  22.73 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5015  AsnC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>