110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4225 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4225  putative heme biosynthesis protein  100 
 
 		 170 aa  350  7e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3128  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 166 aa  164  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0073  AsnC family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 147 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.302073  normal  0.744258 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3268  AsnC family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 152 aa  148  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.573654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1908  AsnC family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 160 aa  147  9e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2492  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.614056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1713  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.63 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259124  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2611  putative transcriptional regulator, AsnC family  47.52 
 
 		 167 aa  140  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.672357  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1446  AsnC family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 163 aa  138  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.855842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0614  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 147 aa  137  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06690  putative transcriptional regulator  42.18 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0225881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3175  nitrite reductase heme biosynthesis G  43.36 
 
 		 149 aa  136  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2081  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 149 aa  134  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566316  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5015  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330876  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.27 
 
 		 360 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1614  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.91 
 
 		 359 aa  125  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000928597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1585  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.73 
 
 		 345 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2158  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 153 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.53463  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1221  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.6 
 
 		 363 aa  118  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0086  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.01 
 
 		 371 aa  117  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2894  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.73 
 
 		 349 aa  117  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0895159  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1129  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.48 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.875514 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0286  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.21 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0511  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.37 
 
 		 346 aa  115  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3126  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1256  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.81 
 
 		 155 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.387392  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4224  putative heme biosynthesis protein  37.5 
 
 		 372 aa  114  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1342  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06710  putative transcriptional regulator  34.72 
 
 		 150 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0616  putative transcriptional regulator  34.72 
 
 		 150 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2130  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.67 
 
 		 361 aa  108  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.826373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1909  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 348 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0074  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 334 aa  105  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1714  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.43 
 
 		 348 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2129  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 176 aa  104  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1232  AsnC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 151 aa  104  7e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000917912  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2198  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00973271  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2578  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 164 aa  101  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  32.67 
 
 		 769 aa  100  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1255  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.86 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0692  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1459  AsnC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 182 aa  99  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1956  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 		 165 aa  98.6  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.231554 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3349  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 		 337 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3269  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 322 aa  95.1  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.764297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2394  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 152 aa  94  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0512  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 341 aa  92.8  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2066  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.82 
 
 		 359 aa  92.8  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.348008  hitchhiker  0.0096425 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12320  transcriptional regulator  34.25 
 
 		 385 aa  92  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0878  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 164 aa  91.3  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0177181  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2900  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.07 
 
 		 165 aa  90.9  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179211 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0464  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 150 aa  90.9  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000584146  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0957  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 165 aa  90.5  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3176  nitrite reductase heme biosynthesis D protein  31.91 
 
 		 331 aa  89  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2491  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 323 aa  87.8  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.635562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5931  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.86 
 
 		 361 aa  87.8  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.7792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1134  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 149 aa  87  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0641869  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0344  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 		 337 aa  86.7  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00313859  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4937  putative AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 330 aa  86.3  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.456473 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2627  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.48 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0212574 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2246  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 323 aa  85.5  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  0.373627 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5014  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 327 aa  85.1  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2287  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 351 aa  84.7  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0044  AsnC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 332 aa  84.7  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.268461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1708  AsnC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 323 aa  84.3  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00654875 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2612  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.06 
 
 		 349 aa  84  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4037  AsnC family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1976  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 332 aa  80.9  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.481877  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0505  AsnC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 353 aa  79  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0453  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.08 
 
 		 338 aa  79  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000254867  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0962  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 322 aa  77.8  0.00000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.571479  hitchhiker  0.00125709 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0150  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 321 aa  68.6  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.587546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1231  AsnC family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000551227  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2996  AsnC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2422  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.29 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000360306 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1445  AsnC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.943985 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0047  AsnC family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0361845  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1130  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.37 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.853414 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1222  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.98 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1460  AsnC family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1341  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0013  AsnC family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000293296  normal  0.0126394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06700  heme d1 biosynthesis protein NirL  27.94 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0791164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0693  AsnC family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2610  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.27 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5016  AsnC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380949  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3179  AsnC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 158 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0615  heme d1 biosynthesis protein NirL  31.13 
 
 		 174 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2493  AsnC family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 160 aa  51.2  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1257  putative transcriptional regulator, AsnC family  22.39 
 
 		 155 aa  51.2  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0072  AsnC family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.598742  normal  0.790433 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2018  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.47 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06680  hypothetical protein  26.15 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00214108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2157  AsnC family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.91704  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1254  putative transcriptional regulator, AsnC family  22.39 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0613  hypothetical protein  24.62 
 
 		 171 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3267  AsnC family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1907  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2197  AsnC family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00194036  normal  0.364618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1712  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.61 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>