111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1447 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1447  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 160 aa  328  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.836924 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1907  AsnC family transcriptional regulator  81.13 
 
 		 160 aa  261  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1712  putative transcriptional regulator, AsnC family  80.5 
 
 		 160 aa  260  4.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3267  AsnC family transcriptional regulator  68.59 
 
 		 158 aa  224  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0072  AsnC family transcriptional regulator  66.03 
 
 		 166 aa  215  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.598742  normal  0.790433 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3174  putative nitrite reductase heme biosynthesis H protein  64.78 
 
 		 161 aa  209  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2610  putative transcriptional regulator, AsnC family  65 
 
 		 189 aa  208  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5016  AsnC family transcriptional regulator  64.94 
 
 		 166 aa  205  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380949  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2493  AsnC family transcriptional regulator  66.03 
 
 		 160 aa  203  6e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3129  AsnC family transcriptional regulator  60.78 
 
 		 173 aa  201  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06680  hypothetical protein  54.25 
 
 		 171 aa  169  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00214108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0613  hypothetical protein  52.63 
 
 		 171 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4226  putative heme biosythesis protein  45.88 
 
 		 183 aa  163  9e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1221  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.41 
 
 		 363 aa  158  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.41 
 
 		 360 aa  153  9e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2130  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.95 
 
 		 361 aa  150  8e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.826373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1614  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.52 
 
 		 359 aa  146  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000928597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0074  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 334 aa  135  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1231  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000551227  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2157  AsnC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.91704  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3269  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 322 aa  128  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.764297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2612  putative transcriptional regulator, AsnC family  46.1 
 
 		 349 aa  127  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4224  putative heme biosynthesis protein  41.22 
 
 		 372 aa  122  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4937  putative AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 330 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.456473 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1460  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2894  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.3 
 
 		 349 aa  121  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0895159  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1130  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.95 
 
 		 176 aa  120  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.853414 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0086  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.79 
 
 		 371 aa  120  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1257  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.66 
 
 		 155 aa  120  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3349  putative transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 337 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0511  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.58 
 
 		 346 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2287  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 351 aa  117  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5931  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.26 
 
 		 361 aa  117  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.7792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5014  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 327 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3127  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 178 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0615  heme d1 biosynthesis protein NirL  43.06 
 
 		 174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1585  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.56 
 
 		 345 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06700  heme d1 biosynthesis protein NirL  42.36 
 
 		 174 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0791164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0344  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.31 
 
 		 337 aa  114  7.999999999999999e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00313859  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1976  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 332 aa  113  8.999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.481877  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1445  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 338 aa  113  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.943985 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2066  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.42 
 
 		 359 aa  112  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.348008  hitchhiker  0.0096425 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0505  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 353 aa  110  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0047  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0361845  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4037  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 328 aa  108  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2996  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0512  AsnC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 341 aa  108  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0453  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 		 338 aa  107  7.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000254867  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1341  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 155 aa  107  9.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2197  AsnC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00194036  normal  0.364618 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3176  nitrite reductase heme biosynthesis D protein  38.06 
 
 		 331 aa  104  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1909  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 348 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0956  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 162 aa  101  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1254  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 161 aa  100  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1714  putative transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 348 aa  100  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2422  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.76 
 
 		 161 aa  98.2  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000360306 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3179  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 158 aa  95.1  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2018  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 159 aa  94.4  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12320  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 385 aa  90.5  8e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0693  AsnC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0877  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 164 aa  88.2  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173236  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2491  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 323 aa  87.4  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.635562 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0219  AsnC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 160 aa  87  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.735917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2503  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.03 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2628  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.37 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.977143  normal  0.0209854 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3002  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.94 
 
 		 156 aa  87  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  37.43 
 
 		 769 aa  86.3  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1129  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.85 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.875514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0616  putative transcriptional regulator  34.59 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06710  putative transcriptional regulator  35.34 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2158  AsnC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.53463  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0464  AsnC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000584146  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2394  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1708  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00654875 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2246  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 323 aa  68.9  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  0.373627 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1956  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.231554 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1342  AsnC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0286  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.79 
 
 		 173 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0013  AsnC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 321 aa  63.9  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000293296  normal  0.0126394 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2578  AsnC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1256  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.56 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.387392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0150  AsnC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 321 aa  62  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.587546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0044  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 332 aa  61.2  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.268461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2198  AsnC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00973271  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1232  AsnC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000917912  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0692  AsnC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1255  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3126  AsnC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1134  AsnC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0641869  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1459  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1222  putative transcriptional regulator, AsnC family  21.77 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2900  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179211 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0962  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.571479  hitchhiker  0.00125709 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2611  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.65 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.672357  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0878  AsnC family transcriptional regulator  33 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0177181  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4225  putative heme biosynthesis protein  26.12 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2129  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1908  AsnC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0957  AsnC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1713  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.95 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>