104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_06680 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_06680  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  346  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00214108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0613  hypothetical protein  96.49 
 
 		 171 aa  337  5e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3129  AsnC family transcriptional regulator  56.4 
 
 		 173 aa  199  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0072  AsnC family transcriptional regulator  61.59 
 
 		 166 aa  190  9e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.598742  normal  0.790433 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2493  AsnC family transcriptional regulator  61.39 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4226  putative heme biosythesis protein  53.33 
 
 		 183 aa  185  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3174  putative nitrite reductase heme biosynthesis H protein  57.89 
 
 		 161 aa  181  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3267  AsnC family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 158 aa  176  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5016  AsnC family transcriptional regulator  59.46 
 
 		 166 aa  174  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380949  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1907  AsnC family transcriptional regulator  57.24 
 
 		 160 aa  175  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1712  putative transcriptional regulator, AsnC family  56.58 
 
 		 160 aa  173  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1447  AsnC family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 160 aa  154  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.836924 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2610  putative transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 189 aa  148  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1221  putative transcriptional regulator, AsnC family  47.02 
 
 		 363 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2130  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.48 
 
 		 361 aa  143  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.826373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.97 
 
 		 360 aa  142  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1614  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 		 359 aa  138  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000928597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0074  AsnC family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 334 aa  132  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3269  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 322 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.764297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1460  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1231  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000551227  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1585  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.79 
 
 		 345 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4937  putative AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 330 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.456473 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2612  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.61 
 
 		 349 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2018  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.02 
 
 		 159 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0344  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.62 
 
 		 337 aa  105  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00313859  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1976  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 332 aa  105  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.481877  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2894  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.78 
 
 		 349 aa  105  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0895159  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2503  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.19 
 
 		 166 aa  104  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2157  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 157 aa  103  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.91704  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5014  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 327 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0086  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.58 
 
 		 371 aa  103  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4037  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 328 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1257  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0615  heme d1 biosynthesis protein NirL  40 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3179  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 158 aa  102  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0511  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.78 
 
 		 346 aa  101  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2996  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 159 aa  100  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4224  putative heme biosynthesis protein  35.9 
 
 		 372 aa  99.8  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3127  AsnC family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06700  heme d1 biosynthesis protein NirL  40.44 
 
 		 174 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0791164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1130  putative transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 176 aa  98.6  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.853414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3349  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.2 
 
 		 337 aa  99  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2287  AsnC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 351 aa  98.6  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0512  AsnC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 341 aa  96.7  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0453  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.75 
 
 		 338 aa  96.3  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000254867  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0047  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 162 aa  94  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0361845  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2422  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.49 
 
 		 161 aa  93.6  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000360306 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1909  AsnC family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 348 aa  93.2  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1714  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.41 
 
 		 348 aa  91.7  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5931  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.67 
 
 		 361 aa  89.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.7792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0505  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 353 aa  87.4  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0219  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 160 aa  87.4  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.735917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1445  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 338 aa  86.3  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.943985 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2066  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.67 
 
 		 359 aa  86.3  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.348008  hitchhiker  0.0096425 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0693  AsnC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 156 aa  84.3  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0956  AsnC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3176  nitrite reductase heme biosynthesis D protein  32.69 
 
 		 331 aa  82  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12320  transcriptional regulator  34.84 
 
 		 385 aa  81.6  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1341  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  32.5 
 
 		 769 aa  80.1  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1254  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.94 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2491  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.635562 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2628  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.977143  normal  0.0209854 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2197  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00194036  normal  0.364618 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0877  AsnC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173236  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3002  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.9 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2627  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.58 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0212574 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1342  AsnC family transcriptional regulator  39 
 
 		 157 aa  62  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06710  putative transcriptional regulator  32.77 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0616  putative transcriptional regulator  32.77 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1956  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.59 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.231554 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1256  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.387392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2158  AsnC family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.53463  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0692  AsnC family transcriptional regulator  27 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0878  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0177181  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1255  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.91 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2394  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1708  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 323 aa  55.5  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00654875 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1222  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.83 
 
 		 327 aa  53.9  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2129  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0013  AsnC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 321 aa  53.9  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000293296  normal  0.0126394 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2578  AsnC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2198  AsnC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00973271  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1232  AsnC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000917912  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0957  AsnC family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2246  AsnC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 323 aa  52  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  0.373627 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2081  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 149 aa  51.6  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566316  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0044  AsnC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 332 aa  50.4  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.268461  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4225  putative heme biosynthesis protein  26.15 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0962  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 322 aa  49.3  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.571479  hitchhiker  0.00125709 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1129  putative transcriptional regulator, AsnC family  22.55 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.875514 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1908  AsnC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 160 aa  48.5  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1713  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.19 
 
 		 160 aa  48.5  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259124  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1459  AsnC family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 182 aa  48.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0464  AsnC family transcriptional regulator  31 
 
 		 150 aa  48.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000584146  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0150  AsnC family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 321 aa  47  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.587546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1134  AsnC family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0641869  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2900  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.43 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179211 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5015  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>