103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_06700 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_06700  heme d1 biosynthesis protein NirL  100 
 
 		 174 aa  351  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0791164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0615  heme d1 biosynthesis protein NirL  94.83 
 
 		 174 aa  333  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3269  AsnC family transcriptional regulator  56.44 
 
 		 322 aa  184  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.764297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3127  AsnC family transcriptional regulator  50.31 
 
 		 178 aa  167  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4224  putative heme biosynthesis protein  45.96 
 
 		 372 aa  159  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2612  putative transcriptional regulator, AsnC family  54.17 
 
 		 349 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1909  AsnC family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 348 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1714  putative transcriptional regulator, AsnC family  49.02 
 
 		 348 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0074  AsnC family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 334 aa  139  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4937  putative AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 330 aa  137  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.456473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1445  AsnC family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 338 aa  135  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.943985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5014  AsnC family transcriptional regulator  43.83 
 
 		 327 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0072  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.598742  normal  0.790433 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1585  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.65 
 
 		 345 aa  119  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3267  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1907  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1712  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.66 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1221  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.98 
 
 		 363 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3176  nitrite reductase heme biosynthesis D protein  41.83 
 
 		 331 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0086  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.88 
 
 		 371 aa  111  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1614  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.58 
 
 		 359 aa  110  8.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000928597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2130  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.5 
 
 		 361 aa  110  9e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.826373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.13 
 
 		 360 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5016  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380949  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0505  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 353 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3174  putative nitrite reductase heme biosynthesis H protein  43.75 
 
 		 161 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2894  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.93 
 
 		 349 aa  105  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0895159  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1257  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2491  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 323 aa  105  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.635562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1460  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 152 aa  104  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3179  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 158 aa  103  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0511  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.31 
 
 		 346 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0613  hypothetical protein  41.18 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2610  putative transcriptional regulator, AsnC family  49.02 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1231  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 159 aa  102  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000551227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4037  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 328 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06680  hypothetical protein  40.44 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00214108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1130  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.73 
 
 		 176 aa  99.8  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.853414 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0453  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.37 
 
 		 338 aa  99.4  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000254867  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3129  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 173 aa  99  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1447  AsnC family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 160 aa  99.4  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.836924 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4226  putative heme biosythesis protein  36.76 
 
 		 183 aa  98.6  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2018  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.06 
 
 		 159 aa  97.4  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2157  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 157 aa  97.1  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.91704  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2493  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0512  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 341 aa  96.3  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3349  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 		 337 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0344  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 337 aa  95.5  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00313859  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0047  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 162 aa  94.4  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0361845  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2503  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.86 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1976  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 332 aa  92.8  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.481877  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2066  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.65 
 
 		 359 aa  92.4  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.348008  hitchhiker  0.0096425 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12320  transcriptional regulator  32.68 
 
 		 385 aa  91.7  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1254  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 161 aa  90.9  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2422  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.48 
 
 		 161 aa  90.5  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000360306 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2287  AsnC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 351 aa  86.3  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3002  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 		 156 aa  84.7  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5931  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.76 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.7792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1341  AsnC family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2197  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00194036  normal  0.364618 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0219  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.735917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2996  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0693  AsnC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0877  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173236  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0044  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 332 aa  71.6  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.268461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0956  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2628  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.22 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.977143  normal  0.0209854 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2246  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 323 aa  68.6  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  0.373627 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0150  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 321 aa  67.4  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.587546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0962  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.571479  hitchhiker  0.00125709 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1708  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00654875 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2198  AsnC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00973271  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1256  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.17 
 
 		 155 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.387392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06710  putative transcriptional regulator  32.43 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1129  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.35 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.875514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0616  putative transcriptional regulator  31.53 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0013  AsnC family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 321 aa  57  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000293296  normal  0.0126394 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1956  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.53 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.231554 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1134  AsnC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0641869  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  35.4 
 
 		 769 aa  55.1  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2627  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.83 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0212574 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2158  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.53463  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4225  putative heme biosynthesis protein  27.94 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0692  AsnC family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0957  AsnC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1342  AsnC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1222  putative transcriptional regulator, AsnC family  23.88 
 
 		 327 aa  51.2  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1459  AsnC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3175  nitrite reductase heme biosynthesis G  30.51 
 
 		 149 aa  47.8  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1255  putative transcriptional regulator, AsnC family  24.68 
 
 		 173 aa  48.1  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0073  AsnC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.302073  normal  0.744258 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3128  AsnC family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1908  AsnC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 160 aa  45.1  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0464  AsnC family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 150 aa  44.7  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000584146  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1713  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.38 
 
 		 160 aa  44.7  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259124  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0286  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.43 
 
 		 173 aa  44.7  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2394  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.19 
 
 		 152 aa  44.3  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2900  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179211 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1232  AsnC family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000917912  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>