111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4224 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4224  putative heme biosynthesis protein  100 
 
 		 372 aa  775    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3269  AsnC family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 322 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.764297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0074  AsnC family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 334 aa  277  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2612  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.03 
 
 		 349 aa  249  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1909  AsnC family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 348 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1714  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.42 
 
 		 348 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5014  AsnC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 327 aa  230  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1585  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 		 345 aa  215  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4937  putative AsnC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.456473 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0511  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.28 
 
 		 346 aa  212  7e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2894  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.31 
 
 		 349 aa  212  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0895159  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2491  AsnC family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.635562 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1445  AsnC family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 338 aa  196  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.943985 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0086  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.12 
 
 		 371 aa  196  7e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3127  AsnC family transcriptional regulator  52.02 
 
 		 178 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3176  nitrite reductase heme biosynthesis D protein  32.63 
 
 		 331 aa  190  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1221  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.78 
 
 		 363 aa  188  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3349  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.92 
 
 		 337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.17 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2066  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.34 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.348008  hitchhiker  0.0096425 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4037  AsnC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 328 aa  176  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1614  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.69 
 
 		 359 aa  170  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000928597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2130  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.01 
 
 		 361 aa  169  9e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.826373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12320  transcriptional regulator  30.39 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06700  heme d1 biosynthesis protein NirL  45.96 
 
 		 174 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0791164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0615  heme d1 biosynthesis protein NirL  47.44 
 
 		 174 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0344  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.27 
 
 		 337 aa  159  1e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00313859  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0512  AsnC family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1976  AsnC family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.481877  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2287  AsnC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 351 aa  152  7e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  31.07 
 
 		 769 aa  150  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0453  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.4 
 
 		 338 aa  149  7e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000254867  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0505  AsnC family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 353 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5931  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.31 
 
 		 361 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.7792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06710  putative transcriptional regulator  44.81 
 
 		 150 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0616  putative transcriptional regulator  44.81 
 
 		 150 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3126  AsnC family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 154 aa  136  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0072  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 166 aa  130  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.598742  normal  0.790433 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1712  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.18 
 
 		 160 aa  125  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1907  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 160 aa  124  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1130  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.36 
 
 		 176 aa  123  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.853414 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3267  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 158 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3174  putative nitrite reductase heme biosynthesis H protein  37.93 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3179  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 158 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5016  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 166 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380949  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1257  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.58 
 
 		 155 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1231  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 159 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000551227  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1129  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.27 
 
 		 156 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.875514 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4225  putative heme biosynthesis protein  37.5 
 
 		 170 aa  114  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1460  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 152 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2610  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.2 
 
 		 189 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1341  AsnC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 155 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1447  AsnC family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 160 aa  109  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.836924 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3129  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 173 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2018  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.95 
 
 		 159 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1713  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.01 
 
 		 160 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259124  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4226  putative heme biosythesis protein  45 
 
 		 183 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0219  AsnC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 160 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.735917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1908  AsnC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 160 aa  106  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3128  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 166 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1256  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.55 
 
 		 155 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.387392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0047  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 162 aa  103  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0361845  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2246  AsnC family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 323 aa  104  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  0.373627 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2493  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 160 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2157  AsnC family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 157 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.91704  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2996  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 159 aa  102  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2422  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.44 
 
 		 161 aa  102  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000360306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0613  hypothetical protein  35.9 
 
 		 171 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1254  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.64 
 
 		 161 aa  101  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2197  AsnC family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 160 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00194036  normal  0.364618 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0614  putative transcriptional regulator  36.18 
 
 		 147 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0073  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 147 aa  99.8  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.302073  normal  0.744258 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06680  hypothetical protein  35.9 
 
 		 171 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00214108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06690  putative transcriptional regulator  36.18 
 
 		 147 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0225881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1708  AsnC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 323 aa  99.4  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00654875 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3002  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.49 
 
 		 156 aa  98.6  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2503  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.86 
 
 		 166 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0692  AsnC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 156 aa  96.7  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2198  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 172 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00973271  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1232  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 151 aa  93.6  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000917912  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2158  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 153 aa  93.6  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.53463  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0044  AsnC family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 332 aa  93.2  6e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.268461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3268  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 152 aa  92.8  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.573654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1956  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.3 
 
 		 165 aa  92.8  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.231554 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1342  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 157 aa  92  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0878  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 164 aa  90.9  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0177181  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1446  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 163 aa  90.1  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.855842 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1134  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 149 aa  89  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0641869  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1459  AsnC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 182 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2578  AsnC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 164 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2900  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.37 
 
 		 165 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179211 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0693  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 156 aa  87.4  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0962  AsnC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 322 aa  86.3  8e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.571479  hitchhiker  0.00125709 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2628  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.3 
 
 		 162 aa  86.3  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.977143  normal  0.0209854 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2081  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 149 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566316  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2129  AsnC family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 176 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0877  AsnC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 164 aa  85.9  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173236  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0286  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.32 
 
 		 173 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0013  AsnC family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000293296  normal  0.0126394 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2394  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.37 
 
 		 152 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>