117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3267 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3267  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
158 aa  325  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381934  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0072  AsnC family transcriptional regulator  72.9 
 
 
166 aa  238  2.9999999999999997e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.598742  normal  0.790433 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3174  putative nitrite reductase heme biosynthesis H protein  66.88 
 
 
161 aa  223  9e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5016  AsnC family transcriptional regulator  65.58 
 
 
166 aa  210  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380949  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1907  AsnC family transcriptional regulator  62.82 
 
 
160 aa  208  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1447  AsnC family transcriptional regulator  68.59 
 
 
160 aa  208  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.836924 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1712  putative transcriptional regulator, AsnC family  62.18 
 
 
160 aa  207  5e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2493  AsnC family transcriptional regulator  63.87 
 
 
160 aa  204  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2610  putative transcriptional regulator, AsnC family  62.66 
 
 
189 aa  204  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3129  AsnC family transcriptional regulator  59.48 
 
 
173 aa  199  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4226  putative heme biosythesis protein  47.65 
 
 
183 aa  179  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06680  hypothetical protein  54.55 
 
 
171 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00214108  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0613  hypothetical protein  53.9 
 
 
171 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2130  putative transcriptional regulator, AsnC family  46.15 
 
 
361 aa  159  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.826373  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  46.79 
 
 
360 aa  156  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1221  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.59 
 
 
363 aa  151  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1614  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.88 
 
 
359 aa  147  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000928597  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2157  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.91704  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1231  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 
159 aa  142  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000551227  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0074  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
334 aa  136  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3269  AsnC family transcriptional regulator  44.23 
 
 
322 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.764297  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1460  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 
152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4937  putative AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
330 aa  130  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.456473 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0086  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.97 
 
 
371 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1130  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.29 
 
 
176 aa  125  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.853414 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1257  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.42 
 
 
155 aa  124  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192056  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2612  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.71 
 
 
349 aa  123  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0047  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
162 aa  122  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0361845  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3349  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.49 
 
 
337 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4224  putative heme biosynthesis protein  38.06 
 
 
372 aa  121  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2996  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
159 aa  121  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2287  AsnC family transcriptional regulator  39.49 
 
 
351 aa  120  9e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0344  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.66 
 
 
337 aa  120  9e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00313859  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3127  AsnC family transcriptional regulator  42.57 
 
 
178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5014  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
327 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0615  heme d1 biosynthesis protein NirL  43.54 
 
 
174 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06700  heme d1 biosynthesis protein NirL  42.86 
 
 
174 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0791164  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1585  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 
345 aa  117  6e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208973  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2894  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.78 
 
 
349 aa  117  9e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0895159  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0511  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.75 
 
 
346 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0512  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 
341 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1254  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.01 
 
 
161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0505  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 
353 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4037  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
328 aa  111  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1341  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 
155 aa  112  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2066  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.88 
 
 
359 aa  112  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.348008  hitchhiker  0.0096425 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1976  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 
332 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.481877  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5931  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.16 
 
 
361 aa  110  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.7792  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12320  transcriptional regulator  37.04 
 
 
385 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.601  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2018  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.57 
 
 
159 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2422  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.42 
 
 
161 aa  107  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000360306 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2197  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 
160 aa  106  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00194036  normal  0.364618 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3176  nitrite reductase heme biosynthesis D protein  37.18 
 
 
331 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1445  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 
338 aa  104  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.943985 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3179  AsnC family transcriptional regulator  40.68 
 
 
158 aa  100  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0956  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 
162 aa  99  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2491  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 
323 aa  98.6  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.635562 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0453  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.26 
 
 
338 aa  97.1  9e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000254867  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1909  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 
348 aa  96.3  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1714  putative transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 
348 aa  95.9  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0693  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 
156 aa  94  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2503  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.68 
 
 
166 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0219  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 
160 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.735917  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0877  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
164 aa  91.3  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173236  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2628  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 
162 aa  89.4  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.977143  normal  0.0209854 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3002  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.87 
 
 
156 aa  84.3  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1708  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 
323 aa  79.3  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00654875 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  35.33 
 
 
769 aa  79.3  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1129  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.08 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.875514 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2246  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 
323 aa  77.4  0.00000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  0.373627 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2394  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.19 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1956  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.14 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.231554 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0464  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000584146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1256  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.63 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.387392  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0286  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.15 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0150  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 
321 aa  70.5  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.587546  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0044  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.268461  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2578  AsnC family transcriptional regulator  31.71 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0878  AsnC family transcriptional regulator  32.81 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0177181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06710  putative transcriptional regulator  32.81 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179888  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0616  putative transcriptional regulator  32.81 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2158  AsnC family transcriptional regulator  27.81 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.53463  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0692  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1255  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3126  AsnC family transcriptional regulator  36.19 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2129  AsnC family transcriptional regulator  30.89 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394318  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0962  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
322 aa  63.9  0.0000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.571479  hitchhiker  0.00125709 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2198  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 
172 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00973271  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1232  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000917912  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1134  AsnC family transcriptional regulator  32.32 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0641869  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2627  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.73 
 
 
170 aa  61.6  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0212574 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2900  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 
165 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179211 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1342  AsnC family transcriptional regulator  32.38 
 
 
157 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1908  AsnC family transcriptional regulator  35.78 
 
 
160 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1713  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.78 
 
 
160 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259124  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1222  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.49 
 
 
327 aa  58.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0013  AsnC family transcriptional regulator  30.16 
 
 
321 aa  58.9  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000293296  normal  0.0126394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1459  AsnC family transcriptional regulator  27.07 
 
 
182 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2611  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.62 
 
 
167 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.672357  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3128  AsnC family transcriptional regulator  28.85 
 
 
166 aa  55.1  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>