155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2422 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2422  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
161 aa  336  8e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000360306 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3002  putative transcriptional regulator, AsnC family  67.1 
 
 
156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3179  AsnC family transcriptional regulator  57.96 
 
 
158 aa  184  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0219  AsnC family transcriptional regulator  56.33 
 
 
160 aa  179  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.735917  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2018  putative transcriptional regulator, AsnC family  52.56 
 
 
159 aa  174  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2503  putative transcriptional regulator, AsnC family  54.19 
 
 
166 aa  168  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2996  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 
159 aa  156  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3349  putative transcriptional regulator, AsnC family  49.33 
 
 
337 aa  154  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1130  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.52 
 
 
176 aa  151  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.853414 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1231  AsnC family transcriptional regulator  45.27 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000551227  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0047  AsnC family transcriptional regulator  43.67 
 
 
162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0361845  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1341  AsnC family transcriptional regulator  44.81 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2157  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 
157 aa  141  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.91704  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1460  AsnC family transcriptional regulator  42.57 
 
 
152 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1257  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.61 
 
 
155 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192056  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4037  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
328 aa  134  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1254  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.96 
 
 
161 aa  133  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0693  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2197  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 
160 aa  128  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00194036  normal  0.364618 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12320  transcriptional regulator  40.36 
 
 
385 aa  128  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.601  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0505  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 
353 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1976  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 
332 aa  120  8e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.481877  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0512  AsnC family transcriptional regulator  33.54 
 
 
341 aa  117  6e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2066  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 
359 aa  116  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.348008  hitchhiker  0.0096425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5931  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 
361 aa  116  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.7792  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0344  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.09 
 
 
337 aa  114  3.9999999999999997e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00313859  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.89 
 
 
360 aa  110  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2287  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 
351 aa  109  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5016  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380949  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0074  AsnC family transcriptional regulator  37.34 
 
 
334 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3269  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
322 aa  107  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.764297  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3267  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
158 aa  107  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381934  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1585  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.82 
 
 
345 aa  106  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208973  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1221  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.11 
 
 
363 aa  105  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2894  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.19 
 
 
349 aa  105  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0895159  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0877  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 
164 aa  105  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173236  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0453  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.9 
 
 
338 aa  105  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000254867  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2612  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.49 
 
 
349 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4224  putative heme biosynthesis protein  34.44 
 
 
372 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2130  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.59 
 
 
361 aa  102  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.826373  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2610  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.71 
 
 
189 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0086  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.54 
 
 
371 aa  101  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0956  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 
162 aa  100  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0072  AsnC family transcriptional regulator  33.96 
 
 
166 aa  100  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.598742  normal  0.790433 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0511  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.58 
 
 
346 aa  100  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1614  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.22 
 
 
359 aa  99.4  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000928597  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1907  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 
160 aa  98.6  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1712  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.48 
 
 
160 aa  97.1  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3174  putative nitrite reductase heme biosynthesis H protein  35.1 
 
 
161 aa  96.7  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3127  AsnC family transcriptional regulator  33.94 
 
 
178 aa  95.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3176  nitrite reductase heme biosynthesis D protein  37.01 
 
 
331 aa  95.5  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0613  hypothetical protein  37.75 
 
 
171 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06680  hypothetical protein  36.49 
 
 
171 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00214108  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06700  heme d1 biosynthesis protein NirL  36.48 
 
 
174 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0791164  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3129  AsnC family transcriptional regulator  30.97 
 
 
173 aa  90.9  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4937  putative AsnC family transcriptional regulator  31.29 
 
 
330 aa  88.6  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.456473 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5014  AsnC family transcriptional regulator  32.47 
 
 
327 aa  88.2  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0615  heme d1 biosynthesis protein NirL  35.85 
 
 
174 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1447  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 
160 aa  85.9  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.836924 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2493  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
160 aa  84.7  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1445  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 
338 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.943985 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4226  putative heme biosythesis protein  29.83 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2628  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.977143  normal  0.0209854 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1714  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.21 
 
 
348 aa  77.8  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1909  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 
348 aa  77.8  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  33.77 
 
 
769 aa  77.4  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06710  putative transcriptional regulator  33.86 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179888  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1222  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 
327 aa  70.9  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0616  putative transcriptional regulator  33.86 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0692  AsnC family transcriptional regulator  27.21 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2491  AsnC family transcriptional regulator  27.74 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.635562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1459  AsnC family transcriptional regulator  31.34 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1232  AsnC family transcriptional regulator  28.36 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000917912  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4225  putative heme biosynthesis protein  29.29 
 
 
170 aa  63.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1255  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1256  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.19 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.387392  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1713  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.66 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259124  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0013  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
321 aa  62  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000293296  normal  0.0126394 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0464  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 
150 aa  61.6  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000584146  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1908  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 
160 aa  61.2  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3128  AsnC family transcriptional regulator  27.97 
 
 
166 aa  60.8  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1342  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 
157 aa  60.8  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2158  AsnC family transcriptional regulator  30.37 
 
 
153 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.53463  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2627  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.68 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0212574 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1129  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.06 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.875514 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1956  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 
165 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.231554 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1708  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 
323 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00654875 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0150  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 
321 aa  57  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.587546  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2246  AsnC family transcriptional regulator  31.78 
 
 
323 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  0.373627 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0286  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.74 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1446  AsnC family transcriptional regulator  30.6 
 
 
163 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.855842 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2394  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.69 
 
 
152 aa  55.1  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2578  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 
164 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2198  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
172 aa  53.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00973271  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2492  AsnC family transcriptional regulator  25.74 
 
 
157 aa  50.8  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.614056 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0073  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.302073  normal  0.744258 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2900  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179211 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1134  AsnC family transcriptional regulator  29.01 
 
 
149 aa  49.7  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0641869  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0044  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
332 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.268461  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>