111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1714 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1909  AsnC family transcriptional regulator  98.56 
 
 
348 aa  695    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1714  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
348 aa  704    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1445  AsnC family transcriptional regulator  61.56 
 
 
338 aa  332  5e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.943985 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0074  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
334 aa  295  8e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3269  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 
322 aa  278  9e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.764297  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2612  putative transcriptional regulator, AsnC family  47.35 
 
 
349 aa  257  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4224  putative heme biosynthesis protein  39.47 
 
 
372 aa  244  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5014  AsnC family transcriptional regulator  41.16 
 
 
327 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3176  nitrite reductase heme biosynthesis D protein  42.27 
 
 
331 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1585  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.82 
 
 
345 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208973  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4937  putative AsnC family transcriptional regulator  40.25 
 
 
330 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.456473 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2491  AsnC family transcriptional regulator  40.84 
 
 
323 aa  204  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.635562 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2894  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.73 
 
 
349 aa  195  9e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0895159  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0086  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.28 
 
 
371 aa  192  7e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0511  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 
346 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1614  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.59 
 
 
359 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000928597  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
360 aa  179  7e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2066  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.96 
 
 
359 aa  176  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.348008  hitchhiker  0.0096425 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0505  AsnC family transcriptional regulator  33.03 
 
 
353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1221  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.42 
 
 
363 aa  170  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4037  AsnC family transcriptional regulator  29.94 
 
 
328 aa  165  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2130  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.5 
 
 
361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.826373  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0344  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.85 
 
 
337 aa  159  5e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00313859  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0512  AsnC family transcriptional regulator  28.24 
 
 
341 aa  154  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  33.72 
 
 
769 aa  154  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3349  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.24 
 
 
337 aa  153  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12320  transcriptional regulator  29.06 
 
 
385 aa  151  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.601  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0615  heme d1 biosynthesis protein NirL  49.67 
 
 
174 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06700  heme d1 biosynthesis protein NirL  49.02 
 
 
174 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0791164  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1976  AsnC family transcriptional regulator  25.62 
 
 
332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.481877  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3126  AsnC family transcriptional regulator  45.21 
 
 
154 aa  139  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3127  AsnC family transcriptional regulator  46.79 
 
 
178 aa  139  7.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2287  AsnC family transcriptional regulator  29.78 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0453  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.99 
 
 
338 aa  134  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000254867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06710  putative transcriptional regulator  49.29 
 
 
150 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179888  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0616  putative transcriptional regulator  49.29 
 
 
150 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1708  AsnC family transcriptional regulator  29.25 
 
 
323 aa  124  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00654875 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5931  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
361 aa  122  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.7792  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2246  AsnC family transcriptional regulator  28.31 
 
 
323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  0.373627 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2198  AsnC family transcriptional regulator  41.43 
 
 
172 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00973271  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0044  AsnC family transcriptional regulator  30.03 
 
 
332 aa  114  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.268461  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0464  AsnC family transcriptional regulator  40.69 
 
 
150 aa  109  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000584146  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0072  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 
166 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.598742  normal  0.790433 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3175  nitrite reductase heme biosynthesis G  40.85 
 
 
149 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0962  AsnC family transcriptional regulator  30.86 
 
 
322 aa  107  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.571479  hitchhiker  0.00125709 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2158  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
153 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.53463  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1232  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 
151 aa  105  9e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000917912  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0692  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
156 aa  105  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2492  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
157 aa  105  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.614056 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4225  putative heme biosynthesis protein  36.43 
 
 
170 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1459  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 
182 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0286  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.19 
 
 
173 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1713  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.22 
 
 
160 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259124  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1908  AsnC family transcriptional regulator  42.22 
 
 
160 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1256  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.17 
 
 
155 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.387392  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1255  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.73 
 
 
173 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1712  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 
160 aa  100  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2493  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 
160 aa  99.8  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0150  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 
321 aa  99.8  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.587546  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1907  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
160 aa  99.4  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1446  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 
163 aa  99.4  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.855842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1460  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 
152 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2996  AsnC family transcriptional regulator  34.19 
 
 
159 aa  97.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2394  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.43 
 
 
152 aa  97.1  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2627  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.46 
 
 
170 aa  96.3  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0212574 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1257  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.55 
 
 
155 aa  96.3  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192056  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3267  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 
158 aa  95.9  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381934  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1231  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 
159 aa  95.9  9e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000551227  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0073  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 
147 aa  95.1  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.302073  normal  0.744258 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1129  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 
156 aa  94.7  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.875514 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2578  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 
164 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1222  putative transcriptional regulator, AsnC family  21.23 
 
 
327 aa  91.3  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3268  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
152 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.573654  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06680  hypothetical protein  37.41 
 
 
171 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00214108  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0878  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 
164 aa  91.3  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0177181  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0013  AsnC family transcriptional regulator  22.53 
 
 
321 aa  91.7  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000293296  normal  0.0126394 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0613  hypothetical protein  37.41 
 
 
171 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1956  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.06 
 
 
165 aa  91.3  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.231554 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2129  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 
176 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394318  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1342  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 
157 aa  90.1  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3174  putative nitrite reductase heme biosynthesis H protein  37.33 
 
 
161 aa  90.1  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3128  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 
166 aa  89.4  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2157  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 
157 aa  89.4  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.91704  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1254  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.64 
 
 
161 aa  88.6  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1130  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 
176 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.853414 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4226  putative heme biosythesis protein  32.8 
 
 
183 aa  87.4  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1447  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
160 aa  86.3  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.836924 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1134  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 
149 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0641869  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2081  AsnC family transcriptional regulator  36.57 
 
 
149 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566316  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0957  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 
165 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1341  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 
155 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3129  AsnC family transcriptional regulator  33.54 
 
 
173 aa  84  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0614  putative transcriptional regulator  37.86 
 
 
147 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2611  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.97 
 
 
167 aa  84  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.672357  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2900  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 
165 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06690  putative transcriptional regulator  37.14 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0225881  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5015  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 
151 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330876  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5016  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
166 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380949  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2018  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.41 
 
 
159 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0047  AsnC family transcriptional regulator  30.19 
 
 
162 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0361845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>