More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1179 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 149 aa  299  9e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  37.41 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  34.87 
 
 		 157 aa  111  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  38.24 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.78 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.04 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  37.5 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  35.51 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.33 
 
 		 153 aa  107  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.33 
 
 		 153 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.33 
 
 		 153 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.03 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.03 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.03 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.29 
 
 		 153 aa  107  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.77 
 
 		 154 aa  107  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  35.92 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.03 
 
 		 153 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.03 
 
 		 153 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.76 
 
 		 153 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0022  transcriptional regulator, AsnC family  37.24 
 
 		 164 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  35.29 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.29 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.78 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.03 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.29 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.29 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.29 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.78 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.03 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.06 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.03 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.06 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 155 aa  103  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  34.78 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.06 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.06 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.76 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.06 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  35.25 
 
 		 160 aa  102  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 170 aa  101  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.58 
 
 		 152 aa  100  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.33 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.33 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.33 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 140 aa  98.6  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.85 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  32.85 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.85 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.85 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.85 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.85 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  32.85 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.85 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 156 aa  97.8  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 156 aa  97.1  8e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 156 aa  95.9  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.62 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3924  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 150 aa  94.7  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1908  transcriptional regulator, AsnC family  38.52 
 
 		 168 aa  94.4  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 181 aa  94  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 153 aa  93.6  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 151 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  36.23 
 
 		 157 aa  93.6  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 152 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  32.87 
 
 		 203 aa  92  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 153 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  35.17 
 
 		 161 aa  91.7  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 170 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 170 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  36.55 
 
 		 167 aa  91.3  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 161 aa  90.5  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 166 aa  90.9  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 166 aa  90.9  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 170 aa  90.5  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 151 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 		 167 aa  90.9  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  90.5  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17820  transcriptional regulator, AsnC family  36.24 
 
 		 157 aa  89.7  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 160 aa  89.4  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 182 aa  89.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  34.27 
 
 		 152 aa  88.6  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>