More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2047 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2047  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 145 aa  292  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  62.94 
 
 		 152 aa  189  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  62.68 
 
 		 151 aa  188  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 155 aa  186  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  61.54 
 
 		 155 aa  186  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  60.56 
 
 		 152 aa  184  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 165 aa  154  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0435  AsnC family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7223  transcriptional regulator, AsnC family  50.35 
 
 		 160 aa  147  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1713  AsnC family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 160 aa  146  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4300  AsnC family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 160 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3217  AsnC family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 160 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4066  AsnC family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 160 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4306  AsnC family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 160 aa  143  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269184 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3718  AsnC family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 160 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.531548 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4195  AsnC family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 160 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.203034  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 176 aa  140  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 152 aa  133  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  41.96 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  42.07 
 
 		 172 aa  124  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 156 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 156 aa  123  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 156 aa  123  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 156 aa  123  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 156 aa  123  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 152 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 152 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 160 aa  111  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  41.04 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 159 aa  110  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0766  AsnC family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 162 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364193 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  40.56 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  40.28 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  40.29 
 
 		 166 aa  107  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  40.29 
 
 		 167 aa  107  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 172 aa  107  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  41.73 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  41.73 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  41.73 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  41.73 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  40.29 
 
 		 167 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  41.01 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  41.01 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  41.01 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  39.57 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  41.01 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  41.01 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  35.86 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  35.86 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  35.86 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  35.86 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.36 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  39.57 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 175 aa  104  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0797  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 165 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.817989 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  35.86 
 
 		 229 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  39.57 
 
 		 167 aa  104  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 202 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0868  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 165 aa  103  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.67384  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  35.86 
 
 		 229 aa  104  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 202 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0741  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 169 aa  103  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.703113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 162 aa  103  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 174 aa  103  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  39.16 
 
 		 153 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  40.29 
 
 		 165 aa  103  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 162 aa  103  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2804  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 169 aa  103  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 154 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 213 aa  103  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 152 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  35.66 
 
 		 162 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  34.48 
 
 		 175 aa  103  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 153 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2394  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>