More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0671 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
145 aa  291  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0922  alanine catabolic operon transcriptional regulator, putative  60.14 
 
 
155 aa  161  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491746  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1446  AsnC family transcriptional regulator  60.14 
 
 
155 aa  161  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2123  AsnC family transcriptional regulator  62.24 
 
 
149 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0513877  decreased coverage  0.00440064 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8143  transcriptional regulator  55.94 
 
 
153 aa  160  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0298504  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  56.34 
 
 
153 aa  158  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4823  AsnC family transcriptional regulator  55.24 
 
 
149 aa  156  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal  0.0730617 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  53.79 
 
 
174 aa  155  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1095  transcriptional regulator, AsnC family  61.76 
 
 
150 aa  155  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00486405  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4775  transcriptional regulator, AsnC family  53.15 
 
 
154 aa  154  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339738  normal  0.145309 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4829  transcriptional regulator, AsnC family  53.15 
 
 
154 aa  154  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69587  normal  0.0580849 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
158 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  53.15 
 
 
153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  51.39 
 
 
160 aa  151  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  52.08 
 
 
152 aa  150  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  52.08 
 
 
152 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  51.39 
 
 
152 aa  148  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6081  transcriptional regulator  51.47 
 
 
144 aa  147  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  51.72 
 
 
153 aa  146  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  50.35 
 
 
153 aa  144  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  52.45 
 
 
153 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  52.41 
 
 
159 aa  143  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  52.11 
 
 
153 aa  143  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  49.65 
 
 
157 aa  141  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  49.31 
 
 
169 aa  141  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0806  AsnC family transcriptional regulator  50.34 
 
 
150 aa  140  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  48.28 
 
 
157 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  47.92 
 
 
153 aa  138  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 
172 aa  134  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  46.58 
 
 
161 aa  131  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  46.48 
 
 
181 aa  130  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  47.18 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  44.53 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0864  putative alanine catabolic operon transcriptional regulator  61.82 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0261477  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  49.24 
 
 
147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 
154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  47.92 
 
 
154 aa  128  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6436  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 
154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527241  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  44.76 
 
 
153 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  44.76 
 
 
153 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  47.79 
 
 
213 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1520  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 
161 aa  124  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  44.6 
 
 
162 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  43.61 
 
 
155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
152 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
154 aa  123  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
152 aa  123  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
152 aa  123  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
152 aa  123  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  46.48 
 
 
157 aa  123  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
177 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  46.48 
 
 
157 aa  123  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  40.41 
 
 
157 aa  123  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  45.86 
 
 
165 aa  122  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05577  transcription regulator protein  41.26 
 
 
186 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47707  normal  0.300732 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  45.32 
 
 
157 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 
175 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  44.76 
 
 
156 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1897  AsnC family transcriptional regulator  45.77 
 
 
163 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.129627 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  44.29 
 
 
164 aa  121  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 
169 aa  121  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 
202 aa  120  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  42.25 
 
 
175 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  42.25 
 
 
175 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  42.25 
 
 
175 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  42.25 
 
 
175 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0270  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
153 aa  121  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0235772 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  42.25 
 
 
229 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 
155 aa  120  7e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  46.48 
 
 
152 aa  120  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 
156 aa  120  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 
202 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  41.55 
 
 
156 aa  120  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  41.55 
 
 
156 aa  120  8e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  42.25 
 
 
229 aa  120  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1173  AsnC family transcriptional regulator  44.83 
 
 
159 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  46.48 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5478  transcriptional regulator, AsnC family  43.36 
 
 
159 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00532694  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 
175 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1683  AsnC family transcriptional regulator  45 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2003  transcriptional regulator, AsnC family  40.56 
 
 
173 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647714  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3082  transcriptional regulator, AsnC family  42.07 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1696  transcriptional regulator, AsnC family  40.56 
 
 
173 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.346249  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  47.79 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
161 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
161 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3626  AsnC family transcriptional regulator  44.6 
 
 
172 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00949051  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  46.48 
 
 
153 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  47.18 
 
 
153 aa  118  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 
165 aa  117  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  45.93 
 
 
156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  44.12 
 
 
152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>