More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4823 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4823  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
149 aa  298  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal  0.0730617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2123  AsnC family transcriptional regulator  74.66 
 
 
149 aa  201  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0513877  decreased coverage  0.00440064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1095  transcriptional regulator, AsnC family  75.17 
 
 
150 aa  201  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00486405  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0922  alanine catabolic operon transcriptional regulator, putative  64.34 
 
 
155 aa  189  9e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491746  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1446  AsnC family transcriptional regulator  61.49 
 
 
155 aa  188  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6081  transcriptional regulator  61.48 
 
 
144 aa  178  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4829  transcriptional regulator, AsnC family  54.86 
 
 
154 aa  173  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69587  normal  0.0580849 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4775  transcriptional regulator, AsnC family  54.86 
 
 
154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339738  normal  0.145309 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8143  transcriptional regulator  54.86 
 
 
153 aa  172  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0298504  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0806  AsnC family transcriptional regulator  59.57 
 
 
150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  55.24 
 
 
145 aa  156  9e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  51.33 
 
 
174 aa  155  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  54.17 
 
 
159 aa  153  7e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0864  putative alanine catabolic operon transcriptional regulator  64.55 
 
 
132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0261477  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  50.7 
 
 
153 aa  149  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
158 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  51.41 
 
 
152 aa  147  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  50.7 
 
 
152 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  50.7 
 
 
152 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  49.65 
 
 
153 aa  143  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  49.3 
 
 
153 aa  142  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  50.7 
 
 
154 aa  140  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  48.59 
 
 
160 aa  140  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  46.85 
 
 
157 aa  138  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  51.72 
 
 
157 aa  136  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  50.7 
 
 
154 aa  136  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
153 aa  131  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  47.18 
 
 
176 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  47.18 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  47.18 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  43.36 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  46.48 
 
 
156 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  45.32 
 
 
157 aa  128  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  47.89 
 
 
153 aa  127  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 
152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 
154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 
152 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 
152 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 
152 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 
152 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  45.77 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  46.48 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  42.66 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  46.85 
 
 
172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 
177 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 
157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  47.22 
 
 
156 aa  124  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  45.14 
 
 
161 aa  123  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 
163 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 
152 aa  123  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0557  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 
155 aa  122  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.192048 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 
181 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  42.96 
 
 
152 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1520  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 
161 aa  121  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 
175 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1897  AsnC family transcriptional regulator  48.25 
 
 
163 aa  121  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.129627 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0723  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 
154 aa  121  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2062  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 
172 aa  120  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300551  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  42.25 
 
 
175 aa  120  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 
168 aa  120  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
152 aa  120  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  45.83 
 
 
157 aa  120  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  45.83 
 
 
157 aa  120  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 
155 aa  120  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4128  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 
158 aa  120  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 
155 aa  120  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 
162 aa  120  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  41.5 
 
 
164 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0773  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  41.5 
 
 
164 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  41.5 
 
 
164 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  41.5 
 
 
164 aa  119  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  41.5 
 
 
164 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  41.5 
 
 
164 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  41.5 
 
 
164 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  40.14 
 
 
166 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  41.5 
 
 
164 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  45.83 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  42.96 
 
 
229 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  40.82 
 
 
164 aa  118  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  40.82 
 
 
164 aa  118  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  40.82 
 
 
164 aa  118  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 
202 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  40.82 
 
 
164 aa  118  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  40.82 
 
 
164 aa  118  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  42.96 
 
 
175 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  42.96 
 
 
175 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  40.82 
 
 
164 aa  118  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  40.82 
 
 
164 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1683  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 
156 aa  118  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  40.82 
 
 
164 aa  118  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  40.82 
 
 
164 aa  118  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  42.96 
 
 
175 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  42.96 
 
 
175 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  42.25 
 
 
155 aa  118  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  40.82 
 
 
164 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  41.5 
 
 
164 aa  118  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 
175 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  41.5 
 
 
164 aa  118  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>