More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2536 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
155 aa  313  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  94.19 
 
 
155 aa  299  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  86.36 
 
 
155 aa  283  7e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 
154 aa  217  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 
177 aa  214  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  67.11 
 
 
152 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  67.11 
 
 
152 aa  213  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  67.11 
 
 
152 aa  213  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  67.11 
 
 
152 aa  213  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  67.11 
 
 
152 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  66 
 
 
152 aa  208  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  64.29 
 
 
154 aa  208  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  66 
 
 
152 aa  208  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  66 
 
 
152 aa  208  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  62 
 
 
155 aa  206  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  62 
 
 
155 aa  206  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  62 
 
 
155 aa  206  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  64.67 
 
 
152 aa  206  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  64 
 
 
152 aa  205  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 
152 aa  196  7.999999999999999e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  56.49 
 
 
154 aa  192  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0773  AsnC family transcriptional regulator  57.14 
 
 
154 aa  192  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0723  AsnC family transcriptional regulator  57.14 
 
 
154 aa  192  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 
154 aa  160  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 
154 aa  160  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 
154 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  54.67 
 
 
153 aa  159  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  48.7 
 
 
154 aa  157  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  50.99 
 
 
154 aa  152  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 
181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  48.37 
 
 
157 aa  140  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 
157 aa  140  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 
158 aa  140  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 
155 aa  139  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 
156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 
157 aa  138  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 
157 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
157 aa  137  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  46.94 
 
 
154 aa  137  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 
157 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  48 
 
 
157 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 
162 aa  135  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  43.31 
 
 
162 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  43.31 
 
 
162 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 
153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  43.31 
 
 
162 aa  133  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  43.51 
 
 
155 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  41.83 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  56.56 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  44 
 
 
155 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
157 aa  131  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 
154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  44.67 
 
 
153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 
157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  41.56 
 
 
156 aa  130  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  42.38 
 
 
167 aa  130  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  43.71 
 
 
164 aa  130  6.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 
156 aa  130  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  42.26 
 
 
171 aa  130  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  43.05 
 
 
164 aa  130  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  41.67 
 
 
171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  41.67 
 
 
171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  41.67 
 
 
171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  41.67 
 
 
171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  41.72 
 
 
167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  41.57 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  43.05 
 
 
164 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  43.45 
 
 
167 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  41.57 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  41.57 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  41.67 
 
 
222 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3355  putative transcriptional regulator, AsnC family  46 
 
 
150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417846  normal  0.0189646 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  41.57 
 
 
174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
174 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  44.83 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
175 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  40.76 
 
 
164 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
222 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  43.05 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1840  leucine-responsive transcriptional regulator  43.05 
 
 
163 aa  128  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  42.67 
 
 
175 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  48.39 
 
 
160 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  42.67 
 
 
175 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  42.67 
 
 
175 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 
165 aa  128  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  42.67 
 
 
175 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  43.05 
 
 
164 aa  128  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  43.05 
 
 
164 aa  128  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 
167 aa  128  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
218 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 
175 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  48.39 
 
 
160 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  43.05 
 
 
164 aa  128  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  43.45 
 
 
167 aa  128  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  41.33 
 
 
165 aa  128  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>