More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1369 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  311  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  81.7 
 
 		 153 aa  270  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  81.05 
 
 		 153 aa  266  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  81.05 
 
 		 153 aa  264  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  70.67 
 
 		 157 aa  229  9e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  52.41 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  53.15 
 
 		 145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 174 aa  151  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 172 aa  150  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8143  transcriptional regulator  50.68 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0298504  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 152 aa  147  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4829  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69587  normal  0.0580849 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0922  alanine catabolic operon transcriptional regulator, putative  50.68 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491746  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4775  transcriptional regulator, AsnC family  49.32 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339738  normal  0.145309 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 159 aa  144  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1446  AsnC family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4823  AsnC family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 149 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal  0.0730617 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  47.95 
 
 		 169 aa  137  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1095  transcriptional regulator, AsnC family  51.39 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00486405  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2123  AsnC family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0513877  decreased coverage  0.00440064 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  46.94 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1683  AsnC family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 156 aa  130  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 153 aa  130  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  43.84 
 
 		 161 aa  127  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 181 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  44.83 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6081  transcriptional regulator  46.67 
 
 		 144 aa  125  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0557  AsnC family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.192048 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 154 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 157 aa  123  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 154 aa  123  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  42.67 
 
 		 162 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  42.96 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.67 
 
 		 162 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6082  leucine-responsive regulatory protein  43.66 
 
 		 162 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 162 aa  121  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70080  leucine-responsive regulatory protein  43.66 
 
 		 162 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  44.14 
 
 		 175 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  44.14 
 
 		 175 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0806  AsnC family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 153 aa  120  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2062  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 172 aa  120  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  42.76 
 
 		 176 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5478  transcriptional regulator, AsnC family  40.28 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00532694  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  42.96 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1897  AsnC family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.129627 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3355  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.25 
 
 		 150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417846  normal  0.0189646 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  40 
 
 		 166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4128  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48000  leucin responsive regulatory protein  42.96 
 
 		 162 aa  117  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.964771  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0270  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 153 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0235772 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 156 aa  117  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 167 aa  116  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1520  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>