More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1569 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 172 aa  338  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 158 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 153 aa  151  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  49.32 
 
 		 153 aa  151  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 153 aa  150  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 153 aa  145  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  52.35 
 
 		 174 aa  145  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 160 aa  143  9e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 153 aa  142  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 153 aa  140  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 152 aa  140  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  47.55 
 
 		 145 aa  134  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  50 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 159 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 159 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1683  AsnC family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 156 aa  129  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 153 aa  128  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1446  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 155 aa  127  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0922  alanine catabolic operon transcriptional regulator, putative  46.85 
 
 		 155 aa  127  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491746  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 153 aa  127  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4823  AsnC family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal  0.0730617 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  44.3 
 
 		 157 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  43.33 
 
 		 153 aa  124  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  43.33 
 
 		 153 aa  124  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 150 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 153 aa  124  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  42.25 
 
 		 154 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 150 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 150 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1694  AsnC family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.43137  normal  0.666184 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 150 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 158 aa  121  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 157 aa  121  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0557  AsnC family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 155 aa  121  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.192048 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  40.79 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0942  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 168 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  40.88 
 
 		 168 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  40.13 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  42.25 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3495  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302787 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 151 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2050  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 150 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  37.65 
 
 		 155 aa  119  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 150 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 158 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 162 aa  118  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 154 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  37.75 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 157 aa  117  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 154 aa  117  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 		 175 aa  117  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 157 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  42.36 
 
 		 157 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6436  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527241  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 153 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  37.75 
 
 		 156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 155 aa  116  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8143  transcriptional regulator  44.06 
 
 		 153 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0298504  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  40.85 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>