More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4810 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
152 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
154 aa  311  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
152 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
152 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  99.34 
 
 
152 aa  309  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  99.34 
 
 
177 aa  308  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  97.37 
 
 
152 aa  306  5e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  82.12 
 
 
152 aa  270  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  84.77 
 
 
152 aa  268  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  84.11 
 
 
152 aa  265  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  84.11 
 
 
152 aa  265  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  84.11 
 
 
152 aa  265  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  69.54 
 
 
155 aa  229  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  69.54 
 
 
155 aa  229  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  69.54 
 
 
155 aa  229  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  70.86 
 
 
154 aa  228  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  66 
 
 
154 aa  224  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  69.13 
 
 
155 aa  216  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  66.89 
 
 
152 aa  214  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  65.1 
 
 
155 aa  213  7e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  67.11 
 
 
155 aa  213  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0723  AsnC family transcriptional regulator  63.58 
 
 
154 aa  206  7e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0773  AsnC family transcriptional regulator  62.91 
 
 
154 aa  205  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  60.93 
 
 
154 aa  190  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  58.94 
 
 
154 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  57.62 
 
 
154 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  57.62 
 
 
154 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  54.3 
 
 
153 aa  171  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  51.66 
 
 
153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 
181 aa  159  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  52.32 
 
 
157 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  52.32 
 
 
157 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  51.01 
 
 
154 aa  157  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 
157 aa  156  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 
156 aa  154  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  51.01 
 
 
157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  50.99 
 
 
157 aa  153  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 
156 aa  152  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  48.34 
 
 
155 aa  152  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 
152 aa  150  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 
152 aa  149  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 
160 aa  149  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 
158 aa  149  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 
157 aa  148  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  47.68 
 
 
155 aa  149  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 
158 aa  148  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 
155 aa  148  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
152 aa  147  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  49.65 
 
 
154 aa  147  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 
159 aa  147  7e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 
174 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 
153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 
164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  48.32 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  45.03 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
175 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 
155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3355  putative transcriptional regulator, AsnC family  49.66 
 
 
150 aa  144  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417846  normal  0.0189646 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 
153 aa  144  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  46.99 
 
 
168 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  46.99 
 
 
168 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  47.65 
 
 
153 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  46.25 
 
 
165 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  47.02 
 
 
169 aa  143  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  47.27 
 
 
174 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 
156 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 
175 aa  141  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  47.27 
 
 
174 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  47.27 
 
 
174 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  47.27 
 
 
174 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  44.87 
 
 
162 aa  141  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  46.39 
 
 
171 aa  140  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  46.39 
 
 
171 aa  140  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  46.39 
 
 
171 aa  140  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  46.39 
 
 
171 aa  140  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  45.62 
 
 
165 aa  140  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  46.39 
 
 
171 aa  140  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 
156 aa  140  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 
157 aa  140  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 
154 aa  140  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  46.36 
 
 
161 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  46.39 
 
 
222 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 
174 aa  140  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  46.39 
 
 
222 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 
171 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 
161 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  44.23 
 
 
162 aa  140  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  44.23 
 
 
162 aa  140  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  45.89 
 
 
167 aa  140  9e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  44.67 
 
 
161 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 
161 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  44 
 
 
229 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 
162 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 
158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  46.99 
 
 
218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  45.21 
 
 
167 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  41.06 
 
 
157 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>