More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5825 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 156 aa  310  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3795  AsnC family transcriptional regulator  94.77 
 
 		 156 aa  286  7e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  62.09 
 
 		 180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  60.53 
 
 		 166 aa  184  5e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  58.17 
 
 		 159 aa  183  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  61.07 
 
 		 170 aa  183  6e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  59.73 
 
 		 176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 158 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  57.96 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  58.17 
 
 		 160 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  58.33 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  60.93 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  58.33 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 156 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  60.93 
 
 		 161 aa  180  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  61.64 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  57.52 
 
 		 160 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  58.94 
 
 		 166 aa  177  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  58.94 
 
 		 166 aa  177  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  58.94 
 
 		 166 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  59.6 
 
 		 166 aa  176  8e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  57.42 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 164 aa  168  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  58.04 
 
 		 175 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  57.34 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3138  transcriptional regulator AsnC family  56.64 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  54.3 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3204  transcriptional regulator, AsnC family  48.34 
 
 		 170 aa  137  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10165  normal  0.976378 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4045  AsnC family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883438 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 154 aa  130  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 153 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  43.31 
 
 		 162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 174 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  43.31 
 
 		 162 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  43.31 
 
 		 162 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 162 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 164 aa  127  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 154 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 196 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  47.4 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 177 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  43.42 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 167 aa  122  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  36.31 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  41.06 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  41.06 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  41.06 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  41.06 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  43.42 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 202 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 156 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  44.52 
 
 		 155 aa  120  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 175 aa  120  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 152 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  41.06 
 
 		 229 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 152 aa  120  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1555  regulatory protein AsnC/Lrp family  36.36 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 152 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 153 aa  120  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 152 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 202 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  43.42 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  43.42 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  41.45 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 181 aa  119  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  43.42 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  36.65 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  37.66 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  38.56 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  41.06 
 
 		 229 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  44.81 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  41.45 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  38.06 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  38.96 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  38.82 
 
 		 155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>