More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2113 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  319  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  74.36 
 
 		 156 aa  250  6e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  74.36 
 
 		 156 aa  250  6e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  74.36 
 
 		 156 aa  249  7e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  69.87 
 
 		 156 aa  233  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3138  transcriptional regulator AsnC family  70.78 
 
 		 155 aa  229  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  71.9 
 
 		 155 aa  229  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  71.9 
 
 		 175 aa  228  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3795  AsnC family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 156 aa  189  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  59.74 
 
 		 180 aa  188  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  60.96 
 
 		 161 aa  187  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  60.69 
 
 		 166 aa  185  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  57.96 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 		 166 aa  181  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  59.18 
 
 		 166 aa  180  6e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 176 aa  177  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  58.5 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  59.86 
 
 		 160 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  59.86 
 
 		 158 aa  174  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 160 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  55.19 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  57.82 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 159 aa  167  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  58.74 
 
 		 170 aa  166  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  53.1 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  53.15 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3204  transcriptional regulator, AsnC family  52.48 
 
 		 170 aa  142  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10165  normal  0.976378 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  41.26 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  41.06 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  40.4 
 
 		 171 aa  124  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 155 aa  124  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  42.95 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 177 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 171 aa  122  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  42.95 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  42.95 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  39.16 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 156 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 153 aa  121  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 153 aa  120  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  44.76 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  44.76 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  44.76 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  43.06 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 166 aa  120  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  42.38 
 
 		 164 aa  120  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 156 aa  120  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 167 aa  120  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0509  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 167 aa  120  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0842444  normal  0.148048 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  42.38 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  42.38 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  42.38 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  42.38 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  42.38 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  42.38 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  42.38 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  42.38 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  42.38 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  42.38 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  42.38 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  44.06 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  42.38 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  42.31 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  42.38 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  42.38 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  42.38 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  42.38 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  42.31 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  42.31 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  42.31 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  41.26 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  42.38 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  42.31 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  42.31 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  41.06 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>