More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0449 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  304  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  86.27 
 
 		 161 aa  268  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  59.87 
 
 		 181 aa  189  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  61.18 
 
 		 157 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  61.18 
 
 		 157 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 159 aa  171  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 157 aa  169  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  53.59 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  53.59 
 
 		 157 aa  158  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  54.3 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6651  transcriptional regulator, AsnC family  49.34 
 
 		 171 aa  147  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4648  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 163 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  46 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  46.36 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 159 aa  140  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  47.33 
 
 		 154 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  45.39 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  46.36 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  48.68 
 
 		 159 aa  137  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 168 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  47.02 
 
 		 168 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 176 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  44.52 
 
 		 155 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 170 aa  137  7.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 153 aa  135  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  43.79 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 188 aa  136  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  46.05 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  46.05 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 177 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  48.03 
 
 		 169 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  45.33 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  44.08 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  48.03 
 
 		 159 aa  134  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3904  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 186 aa  134  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0974584 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 174 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3501  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.526835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 218 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  46 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  43.11 
 
 		 168 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 174 aa  131  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  43.48 
 
 		 165 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  43.11 
 
 		 168 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  43.14 
 
 		 175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  43.14 
 
 		 175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 174 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 174 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 153 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 174 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 156 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 166 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 152 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 162 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  40.79 
 
 		 152 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 167 aa  130  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  42.51 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  42.51 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  42.51 
 
 		 222 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  42.51 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  42.51 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 222 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>