More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2213 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  100 
 
 		 153 aa  310  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  96.08 
 
 		 153 aa  297  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  89.54 
 
 		 153 aa  280  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  72 
 
 		 153 aa  214  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  64.47 
 
 		 157 aa  210  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  64.67 
 
 		 154 aa  209  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  55.94 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  54.67 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  54 
 
 		 154 aa  158  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  51.7 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  53.02 
 
 		 152 aa  157  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  54 
 
 		 154 aa  157  7e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  52.67 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 155 aa  154  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  52.98 
 
 		 156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  54 
 
 		 158 aa  153  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  51.68 
 
 		 164 aa  153  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 147 aa  150  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 181 aa  148  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  52 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 175 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  44.08 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 175 aa  147  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  48 
 
 		 175 aa  146  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  48 
 
 		 175 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  48 
 
 		 175 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 175 aa  144  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 164 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 174 aa  145  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 152 aa  144  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  48 
 
 		 175 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  48 
 
 		 175 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  44.67 
 
 		 156 aa  144  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 202 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  48 
 
 		 229 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 177 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 202 aa  143  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 154 aa  143  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  49.67 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 164 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 162 aa  142  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 168 aa  141  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  47.33 
 
 		 229 aa  141  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 156 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 156 aa  140  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 156 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 152 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 213 aa  140  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 156 aa  140  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 152 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  48.34 
 
 		 152 aa  140  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 156 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 165 aa  140  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  46.67 
 
 		 152 aa  140  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  44.37 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  46.67 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1446  AsnC family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 155 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 166 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  45.03 
 
 		 159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 158 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 169 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>