More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3888 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 188 aa  386  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4648  AsnC family transcriptional regulator  86.54 
 
 		 163 aa  281  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  83.33 
 
 		 168 aa  273  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  83.33 
 
 		 168 aa  273  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  82.05 
 
 		 158 aa  266  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  77.56 
 
 		 158 aa  253  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  76.28 
 
 		 167 aa  253  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3904  AsnC family transcriptional regulator  66.87 
 
 		 186 aa  231  5e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0974584 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3501  AsnC family transcriptional regulator  67.97 
 
 		 197 aa  226  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.526835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  48.63 
 
 		 161 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 157 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 156 aa  144  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  45.1 
 
 		 157 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 157 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  41.83 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 159 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  44.67 
 
 		 155 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 156 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  43.71 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 154 aa  135  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  41.33 
 
 		 151 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  43.79 
 
 		 157 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 155 aa  132  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  41.14 
 
 		 160 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  43.79 
 
 		 157 aa  131  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 154 aa  131  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 158 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 158 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 158 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 158 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 162 aa  130  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 154 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 156 aa  129  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 156 aa  129  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 160 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  41.83 
 
 		 154 aa  128  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 159 aa  128  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  40.37 
 
 		 169 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 156 aa  127  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  40.76 
 
 		 159 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  38.85 
 
 		 159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 154 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 156 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  40.88 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 157 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  45.03 
 
 		 155 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 154 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 154 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.96 
 
 		 163 aa  124  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  42 
 
 		 229 aa  124  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 154 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 154 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 154 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  40.67 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  40.67 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  40.67 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 159 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  40.67 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 156 aa  123  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 153 aa  122  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6651  transcriptional regulator, AsnC family  39.13 
 
 		 171 aa  122  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 153 aa  122  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 202 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  38.27 
 
 		 229 aa  121  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 159 aa  121  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 		 175 aa  121  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 202 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 158 aa  121  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 152 aa  121  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 157 aa  121  7e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  39.35 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 154 aa  121  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 152 aa  120  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 166 aa  120  9e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 152 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>