More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000530 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  310  2.9999999999999996e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  83.44 
 
 		 160 aa  270  5.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 159 aa  144  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  48.03 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 162 aa  141  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 159 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 159 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 155 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 		 155 aa  137  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 157 aa  137  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 154 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  41.33 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 		 155 aa  135  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.33 
 
 		 155 aa  135  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.33 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  43.33 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 188 aa  134  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 155 aa  133  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 153 aa  133  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4648  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 163 aa  132  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 154 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 154 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 154 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 154 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 153 aa  130  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 174 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 174 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2948  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 162 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.780981 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 174 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3253  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723114  normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5103  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 159 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  41.1 
 
 		 161 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  36.18 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  36.18 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0270  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2198  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 160 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  38.41 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 156 aa  127  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  35.53 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  39.33 
 
 		 167 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1444  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  37.75 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0010  transcriptional regulator, AsnC family  38.26 
 
 		 169 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103438  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 155 aa  124  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0007  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 169 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 163 aa  124  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  37.58 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  38.67 
 
 		 167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0328  transcriptional regulator, AsnC family protein  40 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403986  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1597  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21426  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>