More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3648 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  322  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 159 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 159 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  53.29 
 
 		 159 aa  176  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  53.29 
 
 		 159 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 154 aa  157  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  48.03 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  46.15 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 159 aa  151  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 154 aa  150  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 174 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 174 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 174 aa  148  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  46.36 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 154 aa  147  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 159 aa  144  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 188 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 154 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 154 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 154 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  44.9 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.95 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4648  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 167 aa  141  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  43.14 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2198  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  43.05 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  42 
 
 		 151 aa  134  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 158 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 153 aa  133  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  42 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5249  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.615663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 156 aa  130  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3904  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 186 aa  130  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0974584 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 153 aa  130  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6651  transcriptional regulator, AsnC family  42.38 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 156 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 		 161 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  41.06 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3501  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 197 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.526835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  37.09 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  40.79 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04743  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>