More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2996 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  319  7e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02825  transcriptional regulator, AsnC family protein  92.04 
 
 		 113 aa  209  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263598  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 150 aa  161  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 159 aa  150  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 164 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1610  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 158 aa  148  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0270  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 166 aa  148  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 157 aa  147  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0133  helix-turn-helix, Fis-type  41.72 
 
 		 156 aa  146  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2055  transcriptional regulator AsnC family  45.33 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381037  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2859  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0395  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 164 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0868  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0860  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1597  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21426  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0010  transcriptional regulator, AsnC family  40.4 
 
 		 169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103438  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4264  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 152 aa  145  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.898523  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0273  transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 		 156 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.71 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1752  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 160 aa  144  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2359  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 159 aa  144  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554686  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0453  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  144  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2313  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0459  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 169 aa  144  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32133  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2076  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2964  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 172 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 169 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 163 aa  143  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0362  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 169 aa  142  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1090  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.319701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4315  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.169505  normal  0.387948 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0671  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 160 aa  142  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.633798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1090  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.540988  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1694  transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.849273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2096  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2001  transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0727  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1180  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.210779 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1207  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0850  glutamate uptake regulatory protein Grp  42 
 
 		 159 aa  140  6e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 156 aa  140  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.5 
 
 		 156 aa  140  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2859  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 198 aa  140  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0033406  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  37.25 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0691  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 282 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0463656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1780  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152537  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1375  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 168 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281186  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1179  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.876809  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1508  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 198 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.677694  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0007  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 169 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0461  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 198 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0740  regulatory proteins, AsnC/Lrp  39.74 
 
 		 169 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 156 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1379  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 168 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1883  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 153 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 164 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 157 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  41.1 
 
 		 166 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 152 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1785  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 171 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6107  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 154 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.352577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 155 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4847  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 169 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.14 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  42.76 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  42.76 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  42.76 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  43.71 
 
 		 229 aa  135  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  42.76 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  45.45 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>