More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_5095 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  98.72 
 
 		 156 aa  316  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  99.36 
 
 		 156 aa  316  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  96.79 
 
 		 156 aa  308  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  91.67 
 
 		 156 aa  298  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  89.74 
 
 		 156 aa  284  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  88.46 
 
 		 159 aa  282  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  83.87 
 
 		 155 aa  269  9e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  81.82 
 
 		 157 aa  268  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  81.17 
 
 		 157 aa  265  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  72.9 
 
 		 157 aa  246  7e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  65.36 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  56.49 
 
 		 155 aa  184  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  55.84 
 
 		 155 aa  184  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  52.26 
 
 		 159 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 158 aa  169  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1869  AsnC family transcriptional regulator  52.32 
 
 		 156 aa  166  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1868  AsnC family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 159 aa  165  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1752  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 160 aa  157  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2859  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 198 aa  157  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0033406  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2413  AsnC family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 159 aa  156  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0691  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 282 aa  156  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0463656  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0461  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 198 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1508  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 198 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.677694  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1375  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 168 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281186  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1379  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 168 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1780  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 155 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152537  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1179  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 155 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.876809  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1610  transcriptional regulator, AsnC family  47.33 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 163 aa  154  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 165 aa  152  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2859  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1180  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 156 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.210779 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2096  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 156 aa  151  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1207  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 156 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371155  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0727  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 156 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0007  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 169 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4315  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 156 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.169505  normal  0.387948 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1090  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 156 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.319701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1090  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 156 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.540988  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4847  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 169 aa  150  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 169 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4264  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.898523  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0010  transcriptional regulator, AsnC family  45.33 
 
 		 169 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103438  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0459  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 169 aa  149  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32133  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0362  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 169 aa  148  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6537  transcriptional regulator, AsnC family  45.33 
 
 		 156 aa  147  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.201415 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1597  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 162 aa  147  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21426  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0740  regulatory proteins, AsnC/Lrp  44.67 
 
 		 169 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  48.63 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2001  transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1694  transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.849273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 164 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 153 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 180 aa  144  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0868  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 159 aa  143  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2359  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 159 aa  143  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554686  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0860  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 159 aa  143  8.000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 153 aa  143  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0270  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2055  transcriptional regulator AsnC family  45.03 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381037  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2310  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.67051  normal  0.0460522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1785  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4183  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 195 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7362  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 169 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0360859  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0273  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 		 156 aa  140  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0850  glutamate uptake regulatory protein Grp  45.03 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 153 aa  140  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2076  transcriptional regulator, AsnC family  43.05 
 
 		 162 aa  140  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2313  transcriptional regulator, AsnC family  43.05 
 
 		 162 aa  140  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 153 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1034  transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 		 152 aa  140  9e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 150 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 156 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0133  helix-turn-helix, Fis-type  42 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  43.71 
 
 		 152 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  41.94 
 
 		 172 aa  137  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1057  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2964  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 172 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 154 aa  137  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3254  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 		 153 aa  137  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 177 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1444  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 156 aa  137  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  40.91 
 
 		 154 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 156 aa  136  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0453  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 157 aa  135  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>