More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0376 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 161 aa  320  4e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  86.27 
 
 		 156 aa  268  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  59.21 
 
 		 181 aa  184  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  55.92 
 
 		 157 aa  174  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  55.92 
 
 		 157 aa  174  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 159 aa  169  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  53.29 
 
 		 157 aa  163  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 158 aa  154  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  49.35 
 
 		 157 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  49.35 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6651  transcriptional regulator, AsnC family  47.74 
 
 		 171 aa  147  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 153 aa  144  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  48.03 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 152 aa  142  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4648  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 163 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 152 aa  141  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 152 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 152 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 152 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  46 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 177 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  48.34 
 
 		 159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  47.68 
 
 		 159 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  47.68 
 
 		 169 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  44.08 
 
 		 152 aa  137  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 168 aa  137  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  45.7 
 
 		 168 aa  137  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  43.05 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 188 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  45.03 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  45.03 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  42.76 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  44.52 
 
 		 161 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 158 aa  133  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  42.76 
 
 		 152 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  42.76 
 
 		 152 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 153 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  47.33 
 
 		 153 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  42.76 
 
 		 152 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  43.87 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  43.71 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 156 aa  132  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 152 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  44.67 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  40.4 
 
 		 156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  43.42 
 
 		 175 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 202 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  43.42 
 
 		 175 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  43.42 
 
 		 229 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 202 aa  131  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  43.42 
 
 		 175 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 176 aa  131  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  43.42 
 
 		 175 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 156 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 156 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 171 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 156 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 156 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 174 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 159 aa  130  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 167 aa  130  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 218 aa  130  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  41.45 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  40.65 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 174 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 175 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 174 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 174 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  42.76 
 
 		 229 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>