More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5348 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 156 aa  317  3.9999999999999996e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  80.92 
 
 		 157 aa  259  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  65.36 
 
 		 155 aa  218  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1555  regulatory protein AsnC/Lrp family  52.94 
 
 		 156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0662  hypothetical protein  49.34 
 
 		 163 aa  154  6e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 181 aa  138  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 155 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06912  transcriptional regulator  38.36 
 
 		 171 aa  134  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 159 aa  134  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 177 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  40.4 
 
 		 161 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  38.41 
 
 		 152 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 		 155 aa  130  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 		 154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  40.67 
 
 		 155 aa  128  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 154 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 154 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 155 aa  127  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 154 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  39.07 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  39.07 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  39.07 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  39.07 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  36.42 
 
 		 157 aa  124  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 157 aa  124  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 154 aa  123  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 156 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1042  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  39.04 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.42 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 168 aa  121  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  35.33 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 168 aa  121  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05245  putative AsnC-family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2477  putative leucine-responsive regulatory protein  38.1 
 
 		 154 aa  121  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.728563 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 154 aa  121  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70080  leucine-responsive regulatory protein  36.13 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 162 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6082  leucine-responsive regulatory protein  36.13 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 156 aa  121  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 162 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 153 aa  120  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 159 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  37.01 
 
 		 162 aa  120  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 153 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 159 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 154 aa  120  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 152 aa  120  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 159 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5902  transcriptional regulator, AsnC family  45 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  36.13 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3501  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 197 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.526835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3904  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0974584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 159 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  39.47 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 166 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1595  bkd operon transcriptional regulator  39.1 
 
 		 155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.67 
 
 		 153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 166 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48000  leucin responsive regulatory protein  34.84 
 
 		 162 aa  117  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.964771  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  39.22 
 
 		 164 aa  117  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 188 aa  116  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 153 aa  116  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>