More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2497 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  313  4e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  91.5 
 
 		 157 aa  285  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  87.58 
 
 		 155 aa  278  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  86.93 
 
 		 155 aa  275  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  83.66 
 
 		 154 aa  266  5.9999999999999995e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  84.31 
 
 		 158 aa  266  7e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  81.94 
 
 		 155 aa  259  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  78.43 
 
 		 154 aa  252  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  73.08 
 
 		 156 aa  229  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  65.79 
 
 		 156 aa  200  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  59.35 
 
 		 175 aa  196  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  58.71 
 
 		 175 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  59.6 
 
 		 213 aa  192  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 175 aa  192  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  58.71 
 
 		 169 aa  191  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  58.71 
 
 		 175 aa  191  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  58.71 
 
 		 229 aa  190  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  58.71 
 
 		 175 aa  190  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  58.71 
 
 		 175 aa  190  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  58.71 
 
 		 175 aa  190  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  58.71 
 
 		 175 aa  190  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  58.71 
 
 		 202 aa  190  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  58.71 
 
 		 229 aa  189  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 202 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  59.35 
 
 		 161 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  58.71 
 
 		 161 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  58.71 
 
 		 161 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  56.77 
 
 		 162 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 161 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 153 aa  158  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 159 aa  157  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 153 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 152 aa  155  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6504  AsnC family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 169 aa  155  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845269  normal  0.499109 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3248  AsnC family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 200 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157237  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 152 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 154 aa  154  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 152 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 152 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4915  AsnC family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 200 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903726  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  53.33 
 
 		 153 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 152 aa  153  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 158 aa  150  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  46.71 
 
 		 152 aa  148  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  46.71 
 
 		 152 aa  147  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  46.71 
 
 		 152 aa  147  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  46.71 
 
 		 152 aa  147  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  46.71 
 
 		 152 aa  146  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  52 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  44.52 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 166 aa  143  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  48.68 
 
 		 161 aa  141  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 181 aa  141  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  48.68 
 
 		 161 aa  141  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 164 aa  140  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 152 aa  140  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  46.71 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 155 aa  138  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 154 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 156 aa  135  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 174 aa  135  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  46.71 
 
 		 169 aa  134  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  48.03 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  43.31 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  43.31 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  44.87 
 
 		 161 aa  134  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  42.68 
 
 		 162 aa  133  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  46.71 
 
 		 172 aa  133  9e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  43.51 
 
 		 166 aa  133  9e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  41.61 
 
 		 165 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  41.94 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1683  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  45.45 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  43.33 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 152 aa  131  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>