More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0461 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  326  9e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  80.89 
 
 		 159 aa  266  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  80.89 
 
 		 162 aa  266  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  73.25 
 
 		 166 aa  243  9e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3999  AsnC family transcriptional regulator  68.42 
 
 		 166 aa  221  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4022  AsnC family transcriptional regulator  68.42 
 
 		 166 aa  221  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4115  AsnC family transcriptional regulator  68.42 
 
 		 166 aa  221  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3922  transcriptional regulator, AsnC family  68.42 
 
 		 166 aa  222  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4337  AsnC family transcriptional regulator  68.42 
 
 		 166 aa  221  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  48.05 
 
 		 161 aa  160  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  48.05 
 
 		 155 aa  157  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 159 aa  157  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 165 aa  157  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  51.32 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 157 aa  154  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 153 aa  153  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 158 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 158 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 158 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 158 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  48.68 
 
 		 163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  48.68 
 
 		 159 aa  150  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 159 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 175 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 169 aa  150  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  48.08 
 
 		 169 aa  148  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  46.41 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  48.68 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 156 aa  147  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 169 aa  147  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  45.16 
 
 		 229 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  45.81 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  48.05 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  44.44 
 
 		 175 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  44.44 
 
 		 175 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  44.44 
 
 		 175 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  44.44 
 
 		 175 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 202 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 202 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  44.44 
 
 		 229 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  44.16 
 
 		 175 aa  140  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 158 aa  140  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  44.74 
 
 		 161 aa  140  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  44.74 
 
 		 161 aa  140  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 213 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  43.64 
 
 		 165 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 159 aa  137  7e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  43.48 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  43.48 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 		 172 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  43.48 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 161 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 165 aa  134  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 161 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  43.87 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 171 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  43.23 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 218 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  42.95 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  40.35 
 
 		 171 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  40.35 
 
 		 171 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  40.35 
 
 		 171 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  40.35 
 
 		 171 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 222 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  40.35 
 
 		 222 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  41.29 
 
 		 161 aa  127  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  41.67 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  41.83 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  40.4 
 
 		 160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6436  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527241  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2585  hypothetical protein  41.18 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>