More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0512 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  78.43 
 
 		 161 aa  249  8.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  78.15 
 
 		 157 aa  248  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  73.2 
 
 		 155 aa  239  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  70.97 
 
 		 169 aa  236  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  65.79 
 
 		 157 aa  220  4.9999999999999996e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 153 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  66.45 
 
 		 156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  66.45 
 
 		 161 aa  211  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  66.45 
 
 		 161 aa  211  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 165 aa  206  8e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  62.5 
 
 		 172 aa  200  7e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 159 aa  194  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 158 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 158 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 158 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 158 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  57.52 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  62.34 
 
 		 159 aa  191  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  62.34 
 
 		 163 aa  191  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  62.5 
 
 		 169 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  62.5 
 
 		 159 aa  187  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  61.84 
 
 		 159 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  61.18 
 
 		 159 aa  185  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 157 aa  169  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  52.29 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2585  hypothetical protein  51.63 
 
 		 157 aa  167  6e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3922  transcriptional regulator, AsnC family  51.32 
 
 		 166 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3999  AsnC family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 166 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4115  AsnC family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 166 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4022  AsnC family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 166 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4337  AsnC family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 166 aa  158  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 162 aa  152  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 147 aa  150  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 162 aa  147  4e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 153 aa  143  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  45.75 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 157 aa  140  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 153 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  42.11 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  46.71 
 
 		 153 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 157 aa  137  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 181 aa  136  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6651  transcriptional regulator, AsnC family  45.75 
 
 		 171 aa  134  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  44.03 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 152 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  43.56 
 
 		 165 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  46.05 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  46.41 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  44.74 
 
 		 153 aa  130  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 160 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 160 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 160 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 160 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 160 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 160 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 160 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 155 aa  130  9e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3904  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 186 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0974584 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  38.75 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  42.77 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 153 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  42.77 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  44.05 
 
 		 168 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  44.05 
 
 		 168 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 176 aa  128  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  43.05 
 
 		 175 aa  127  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 175 aa  127  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>